DNA sonification for public engagement in bioinformatics.
DNA sonification for public engagement in bioinformatics.
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DOI：
10.1186/s13104-021-05685-7
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发表时间：
2021-07-15
影响因子：
1.8
通讯作者：
Barker D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Plaisier H;Meagher TR;Barker D
可视化方法，主要是序列数据的彩色编码表示，已经成为DNA数据表示的主要手段。将DNA序列数据的算法转换为声音-超声-代表了使用不同范围的人类感官知觉的另一种表示方法。我们建议，超声对于公众参与DNA序列信息具有价值，因为它具有娱乐性和信息性的潜力。我们开展初步工作，探索DNA序列超声在公众参与生物信息学方面的潜力。我们对DNA应用一种简单的超声技术，其中每个DNA碱基由一个特定的音符表示。此外，可以添加节拍以指示密码子边界或用于音乐效果。我们报告了一个简短的分析，从我们所进行的公共参与活动，采用这种方法的声音。我们报告使用DNA序列超声在两个公共事件。声音化在公众参与生物信息学方面具有潜力，既可以作为数据表示的手段，也可以作为吸引观众到旁听席的手段。我们还讨论了超声技术在生物信息学、公众参与和教育方面的进一步研究方向。
Visualisation methods, primarily color-coded representation of sequence data, have been a predominant means of representation of DNA data. Algorithmic conversion of DNA sequence data to sound—sonification—represents an alternative means of representation that uses a different range of human sensory perception. We propose that sonification has value for public engagement with DNA sequence information because it has potential to be entertaining as well as informative. We conduct preliminary work to explore the potential of DNA sequence sonification in public engagement with bioinformatics. We apply a simple sonification technique for DNA, in which each DNA base is represented by a specific note. Additionally, a beat may be added to indicate codon boundaries or for musical effect. We report a brief analysis from public engagement events we conducted that featured this method of sonification. We report on use of DNA sequence sonification at two public events. Sonification has potential in public engagement with bioinformatics, both as a means of data representation and as a means to attract audience to a drop-in stand. We also discuss further directions for research on integration of sonification into bioinformatics public engagement and education.
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