VARNA: Interactive drawing and editing of the RNA secondary structure.
VARNA: Interactive drawing and editing of the RNA secondary structure.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btp250
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发表时间：
2009-08-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ponty Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Darty K;Denise A;Ponty Y
描述：Varna是一个用于RNA二级结构的自动绘制、可视化和注释的工具，被设计为Web服务器和数据库的配套软件。特点：Varna实现了四种绘制算法，支持使用经典格式DBN、ct、bpseq和RNAML的输入/输出，并将图形导出为五种图片格式，基于像素(JPEG、PNG)或基于矢量(SVG、EPS和XFIG)。它还允许在Web服务器内或通过命令行参数，使用交互式点击法对生成的图形进行手动修改和结构注释。可获得性：VARNA是一个免费软件，根据GPLv3.0许可证条款发布，可通过http://varna.lri.fr联系方式：ponty@lri.fr获得。
Description: VARNA is a tool for the automated drawing, visualization and annotation of the secondary structure of RNA, designed as a companion software for web servers and databases. Features: VARNA implements four drawing algorithms, supports input/output using the classic formats dbn, ct, bpseq and RNAML and exports the drawing as five picture formats, either pixel-based (JPEG, PNG) or vector-based (SVG, EPS and XFIG). It also allows manual modification and structural annotation of the resulting drawing using either an interactive point and click approach, within a web server or through command-line arguments. Availability: VARNA is a free software, released under the terms of the GPLv3.0 license and available at http://varna.lri.fr Contact: ponty@lri.fr Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
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影响因子：
14.9
作者：
Ding, Y;Chan, CY;Lawrence, CE
通讯作者：
Lawrence, CE
DOI：
10.1073/pnas.2536430100
发表时间：
2003-12-23
影响因子：
11.1
作者：
Xayaphoummine, A;Bucher, T;Isambert, H
通讯作者：
Isambert, H
影响因子：
14.9
作者：
Markham NR;Zuker M
通讯作者：
Zuker M
DOI：
10.1073/pnas.0409169102
发表时间：
2005-02-15
影响因子：
11.1
作者：
Washietl, S;Hofacker, IL;Stadler, PF
通讯作者：
Stadler, PF
DOI：
10.1109/tcbb.2008.28
发表时间：
2010-04-01
影响因子：
4.5
作者：
Blin, Guillaume;Denise, Alain;Touzet, Helene
通讯作者：
Touzet, Helene