Molecular dynamics study of the proton pump cycle of bacteriorhodopsin.
Molecular dynamics study of the proton pump cycle of bacteriorhodopsin.
复制标题
细菌视紫红质质子泵循环的分子动力学研究。
DOI：
10.1021/bi00060a022
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发表时间：
1993
期刊：
影响因子：
2.9
通讯作者：
Schulten,K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhou,F;Windemuth,A;Schulten,K
1992年12月14日收到的摘要：视网膜异构化反应，这是功能上重要的质子泵循环的细菌视紫红质，进行了研究的分子动力学模拟完整的蛋白质。视网膜异构化原位模拟占的影响，视黄酸蛋白质的相互作用。所用的蛋白质结构描述于Nonella et al. [Nonella，M.，温德尔，A.，& Schulten，K.（1991）Photochem.光生物学54，937-948]。我们研究了质子泵循环的两种机理，13-顺式异构化模型（CT模型）和13，14-二顺式异构化模型。根据这些模型，retinal经历全反式->> 13-顺式或全反式-> 13-顺式。
Revised Manuscript Received December 14, 1992 abstract: Retinal isomerization reactions, which are functionally important in the proton pump cycle of bacteriorhodopsin, were studied by molecular dynamics simulations performed on the complete protein. Retinal isomerizations were simulated in situ to account for the effects of the retinal-protein interactions. The protein structure employed was that described in Nonella et al.[Nonella, M., Windemuth, A., & Schulten, K.(1991) Photochem. Photobiol. 54, 937-948]. We investigated two mechanisms suggested previously for the proton pump cycle, the 13-cis isomerization model (CT model) and the 13, 14-dicis isomerization model. According to these models, retinal undergoes an all-trans-» 13-cis or an all-trans
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DOI：
10.1073/pnas.85.12.4148
发表时间：
1988-06-01
影响因子：
11.1
作者：
MOGI, T;STERN, LJ;KHORANA, HG
通讯作者：
KHORANA, HG
DOI：
10.1016/s0021-9258(18)45990-x
发表时间：
1992-01
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
K. Rothschild;Y. He;S. Sonar;T. Marti;H. Khorana
通讯作者：
K. Rothschild;Y. He;S. Sonar;T. Marti;H. Khorana
DOI：
10.1021/j100384a017
发表时间：
1990
期刊：
The Journal of Physical Chemistry
影响因子：
--
作者：
M. Grossjean;P. Tavan;K. Schulten
通讯作者：
K. Schulten
C=C-Streckschwingungsfrequenzen in Modellverbindungen der Protonierten Schiff-Base des Retinas
影响因子：
--
作者：
T. Baasov;Mordechai Sheves
通讯作者：
Mordechai Sheves
DOI：
10.1073/pnas.87.24.9774
发表时间：
1990-12-01
影响因子：
11.1
作者：
GERWERT, K;SOUVIGNIER, G;HESS, B
通讯作者：
HESS, B