Hyperaccurate and error-prone ribosomes exploit distinct mechanisms during tRNA selection.
Hyperaccurate and error-prone ribosomes exploit distinct mechanisms during tRNA selection.
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超准确且容易出错的核糖体在 tRNA 选择过程中利用了不同的机制。
DOI：
10.1016/j.molcel.2010.06.009
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发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Green,Rachel
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zaher,HaniS;Green,Rachel
长期以来，表现出超精确(限制性)和核糖体歧义(Ram)表型的大肠埃希氏菌分别与rps Landrps D/rps E的改变有关。结晶学证据表明，核糖体蛋白S12和S4/S5(对应于这些基因)位于核糖体小亚基的不同区域，这对tRNA选择过程中发生的结构域关闭是重要的。从机制上讲，tRNA选择的过程分为两个不同的阶段，初始选择和校对。在这里，我们探索rps Landrps中突变的影响。令人惊讶的是，这两个限制性核糖体主要通过改变近亲tRNA物种的关闭速率来影响tRNA选择，但在整个过程的不同阶段(分别是校对和初始选择)。这些观察表明，小核糖体亚单位两个不同区域的闭合界面(S12/H27/H44和S4/S5)独立发挥作用，促进高保真tRNA选择。
Escherichia colistrains displaying hyperaccurate (restrictive) and ribosomal ambiguity (ram) phenotypes have long been associated with alterations inrpsLandrpsD/rpsE, respectively. Crystallographic evidence shows the ribosomal proteins S12 and S4/S5 (corresponding to these genes) to be located in separate regions of the small ribosomal subunit that are important for domain closure thought to take place during tRNA selection. Mechanistically, the process of tRNA selection is separated into two distinct phases, initial selection and proofreading. Here, we explore the effects of mutations inrpsLandrpsDon these steps. Surprisingly, bothrestrictiveandramribosomes primarily affect tRNA selection through alteration of the off rates of the near-cognate tRNA species but during distinct phases of the overall process (proofreading and initial selection, respectively). These observations suggest that closure interfaces (S12/h27/h44 versus S4/S5) in two distinct regions of the small ribosomal subunit function independently to promote high-fidelity tRNA selection.
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核糖体氨酰-tRNA选择过程中16S rRNA解码区的构象转换
DOI：
10.1038/72364
发表时间：
2000
期刊：
Nature Structural Biology
影响因子：
--
作者：
T. Pape;W. Wintermeyer;M. Rodnina
通讯作者：
M. Rodnina
DOI：
10.1073/pnas.030541097
发表时间：
2000-02-29
影响因子：
11.1
作者：
Freistroffer, DV;Kwiatkowski, M;Ehrenberg, M
通讯作者：
Ehrenberg, M
DOI：
10.1007/bf00328706
发表时间：
1984-01-01
期刊：
MOLECULAR AND GENERAL GENETICS
影响因子：
--
作者：
BOHMAN, K;RUUSALA, T;KURLAND, CG
通讯作者：
KURLAND, CG
影响因子：
64.8
作者：
OZAKI, M;MIZUSHIMA, S;NOMURA, M
通讯作者：
NOMURA, M
DOI：
10.1073/pnas.85.4.1033
发表时间：
1988-02-01
影响因子：
11.1
作者：
SAMPSON, JR;UHLENBECK, OC
通讯作者：
UHLENBECK, OC