An atlas of inter- and intra-tumor heterogeneity of apoptosis competency in colorectal cancer tissue at single-cell resolution.
An atlas of inter- and intra-tumor heterogeneity of apoptosis competency in colorectal cancer tissue at single-cell resolution.
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DOI：
10.1038/s41418-021-00895-9
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发表时间：
2022-04
影响因子：
12.4
通讯作者：
Prehn JHM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lindner AU;Salvucci M;McDonough E;Cho S;Stachtea X;O'Connell EP;Corwin AD;Santamaria-Pang A;Carberry S;Fichtner M;Van Schaeybroeck S;Laurent-Puig P;Burke JP;McNamara DA;Lawler M;Sood A;Graf JF;Rehm M;Dunne PD;Longley DB;Ginty F;Prehn JHM
癌细胞抑制凋亡的能力是恶性转化的关键，并限制了对治疗的反应。在这里，我们对来自168名患者的373个核心的组织微阵列进行了多重免疫荧光分析，分割了240万个细胞，并定量了18种细胞谱系和凋亡蛋白。我们鉴定了免疫中BCL 2的富集，以及癌细胞中巴克、SMAC和XIAP的富集。在单细胞分辨率下进行基于常微分方程的细胞凋亡敏感性建模，并生成细胞凋亡敏感性的肿瘤间和肿瘤内异质性图谱。在单细胞分辨率下的系统建模确定了与免疫和基质细胞相比，癌细胞对线粒体透化和刽子手半胱天冬酶激活的敏感性增强，但显示出显著的肿瘤间和肿瘤内异质性。
Cancer cells’ ability to inhibit apoptosis is key to malignant transformation and limits response to therapy. Here, we performed multiplexed immunofluorescence analysis on tissue microarrays with 373 cores from 168 patients, segmentation of 2.4 million individual cells, and quantification of 18 cell lineage and apoptosis proteins. We identified an enrichment for BCL2 in immune, and BAK, SMAC, and XIAP in cancer cells. Ordinary differential equation-based modeling of apoptosis sensitivity at single-cell resolution was conducted and an atlas of inter- and intra-tumor heterogeneity in apoptosis susceptibility generated. Systems modeling at single-cell resolution identified an enhanced sensitivity of cancer cells to mitochondrial permeabilization and executioner caspase activation compared to immune and stromal cells, but showed significant inter- and intra-tumor heterogeneity.
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影响因子：
12.4
作者：
Ramesh P;Lannagan TRM;Jackstadt R;Atencia Taboada L;Lansu N;Wirapati P;van Hooff SR;Dekker D;Pritchard J;Kirov AB;van Neerven SM;Tejpar S;Kops GJPL;Sansom OJ;Medema JP
通讯作者：
Medema JP
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作者：
Matsutani S;Shibutani M;Maeda K;Nagahara H;Fukuoka T;Nakao S;Hirakawa K;Ohira M
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