湖羊NR5A1基因SNPs筛选及其与产羔数的关联分析
湖羊NR5A1基因SNPs筛选及其与产羔数的关联分析
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DOI：
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
曹少先
中科院分区：
文献类型：
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作者：
李隐侠;张俊;钱勇;孟春花;王慧利;曹少先
为探讨NＲ5A1 基因能否作为湖羊产羔性状的候选基因，同时寻找与湖羊繁殖性能相关的分子标记，以.高繁殖力湖羊为研究对象，采用DNA 池结合测序方法筛选NＲ5A1 基因在湖羊中的SNPs 位点，并利用PCＲ-ＲFLP.和AS-PCＲ 方法进行多态位点分型，利用SPSS 软件分析不同基因型与湖羊产羔数的相关性。结果表明，在湖羊.NＲ5A1 基因中检测到6 个SNPs 位点，分析发现g．6052A/G 位点为TaqI 酶切位点，其余5 个位点处没有酶切位点存.在。在湖羊群体中，g．3362G/C( GG、GC、CC) 、g．4342G/A( GG、GA、AA) 、g．4666C/T( CC、CT、TT) 、g．6052A/G( GG、.AG、AA) 和g．6991T/G( TT、TG、GG) 位点均检测到3 种基因型，而g．5699C/G 位点在湖羊群体中仅发现2 种基因型.GG 和GC。6 个位点的多态信息含量( PIC) 从0．306 到0．375 不等，均属于中度多态( 0．25＜PIC＜0．50) ，杂合度( He).从0．377 到0．500，在这6 个SNPs 位点中，仅g．6052A/G 位点处于Hardy-Weinberg 平衡状态。连锁分析发现，g．3362.G/C 和g．6052A/G 2 位点在湖羊群体中紧密连锁，二者共构建了8 种单倍型组合，AAGG 为主要的单倍型，占总数的.35. 90%，AGCG 和AACG 次之，分别占总数的20. 30%和18. 75%。关联分析发现g．6052A/G 位点GG 型湖羊的平均产.羔数显著高于AA 型( P＜0. 05) 和AG 型( P＜0. 05) ，其余位点的各基因型在湖羊的头胎产羔数、二胎产羔数、三胎产羔.数和平均产羔数间差异均不显著。AAGG 单倍型和AACG 单倍型的二胎产羔数比AGCG 单倍型的二胎产羔数分别.多0. 40 ( P＜0. 05) 和0. 53 ( P＜0. 01) ，差异显著。说明，NＲ5A1 基因对湖羊产羔数有一定的影响，g．6052A/G位点、g．.3362 G/C 和g．6052A/G 连锁可作为湖羊繁殖性能的有效遗传标记，用于湖羊的分子选育。