枇杷 WRKY 转录因子鉴定与表达分析
枇杷 WRKY 转录因子鉴定与表达分析
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DOI：
10.16420/j.issn.0513-353x.2018-01142018-0671
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发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
陈俊伟
中科院分区：
文献类型：
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作者：
李晓颖;徐红霞;陈俊伟
WRKY 转录因子是植物特有的超级基因家族，在调控植物的生长发育、生物和非生物胁迫响应和激素.信号的转导等进程中起着重要作用。本研究以枇杷转录组数据为材料，利用生物信息学手段对枇杷WRKY 转录因.子进行鉴定与特征分析。结果表明，本研究分离鉴定了33 条具典型WRKY 结构域的序列，CDS 长度分布在.492~2040bp，命名为EjWRKY01~EjWRKY33。分组鉴定和进化树分析结果显示，枇杷WRKY 转录因子可分为3 大.类，其中Ⅰ类数量为6 个，Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为22 和5 个，其中Ⅱ类又进一步分为a~e 五个亚类。WRKY 结.构域分析显示，WRKY 结构域高度保守，绝大多数都含有WRKYGQK 七肽和锌指结构。枇杷WRKY 转录因子基.因组DNA 全长895~ 3873bp，编码的蛋白在163 ~ 679 个氨基酸范围内，具有1~5 个不等的内含子。WRKY 启动子.顺式作用元件预测结果表明，大部分WRKY 启动子序列具有典型的 TATA 和 CAAT 元件。将我们获得的所有.WRKY 基因与已报道的拟南芥WRKY 进行进化比对分析发现，所有EjWRKY 基因并没有单独位于独立的分枝上，.表明枇杷的基因序列虽与拟南芥物种有差别，但枇杷WRKY 蛋白质在调控植物生物和非生物逆境反应、信号传导、.生长发育等方面的功能是相似的。此外，荧光定量PCR 结果显示，以大部分EjWRKY 基因均在枇杷的根、茎、叶、.花和果中表达，但其相对表达水平不同，说明WRKY 家族基因在枇杷的生长发育中可能具有不同的功能。