Genevar: a database and Java application for the analysis and visualization of SNP-gene associations in eQTL studies.
Genevar: a database and Java application for the analysis and visualization of SNP-gene associations in eQTL studies.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btq452
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发表时间：
2010-10-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Dermitzakis ET
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yang TP;Beazley C;Montgomery SB;Dimas AS;Gutierrez-Arcelus M;Stranger BE;Deloukas P;Dermitzakis ET
总结：Genevar（GENe Expression VARiation）是一个数据库和Java工具，旨在整合多个数据集，并提供序列变异和基因表达之间关联的分析和可视化。Genevar使研究人员能够在真实的时间内研究感兴趣的基因位点内的表达数量性状位点（eQTL）关联。数据库和应用程序可以以数据库模式安装在标准计算机上，此外，还可以安装在服务器上，以便通过网络服务协议在互联网上在附属机构或更广泛的社区之间共享发现。联系人：emmanouil. unige.ch http://www.sanger.ac.uk/resources/software/genevar
Summary: Genevar (GENe Expression VARiation) is a database and Java tool designed to integrate multiple datasets, and provides analysis and visualization of associations between sequence variation and gene expression. Genevar allows researchers to investigate expression quantitative trait loci (eQTL) associations within a gene locus of interest in real time. The database and application can be installed on a standard computer in database mode and, in addition, on a server to share discoveries among affiliations or the broader community over the Internet via web services protocols. Availability: http://www.sanger.ac.uk/resources/software/genevar Contact: emmanouil.dermitzakis@unige.ch
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