红腺忍冬转录因子LhMYB1的克隆及其功能初步分析
红腺忍冬转录因子LhMYB1的克隆及其功能初步分析
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期刊：
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通讯作者：
莫乔程
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作者：
师凤华（通讯作者）;谭木秀;刘凤鸣;莫乔程
目的：在红腺忍冬(Lonicera hypoglauca Miq.)中克隆一条MYB基因，分析推测它的结构和功能。方法：以转录组测序得到的一个MYB基因序列进行引物设计，用RT-PCR的方法克隆全长；对该基因所编码的氨基酸序列进行生信分析、进化树分析和同源比较，确定其结构特征和所属的基因亚家族；再通过在不同浓度PEG6000处理24小时后的植株叶片该基因表达模式与相对应的叶片含水量、叶绿素含量、超氧化物歧化酶（SOD酶）活性和可溶性蛋白质含量4个生理指标的变化作线性回归分析初步推测其功能。结果：本实验从红腺忍冬叶片成功克隆出一个MYB转录因子，该基因编码区长909 bp，编码302个氨基酸残基；DNA结合区域位于N端，长53个氨基酸残基，形成3个螺旋，其中含有两个间距为19个氨基酸残基的色氨酸；这段区域的第3个螺旋含有MYBR1转录因子CCA1-like/R-R亚族的特征模块SHAQKYF；此转录因子位于MYBR1转录因子类群。此基因受到PEG诱导调节，其相对表达量随着PEG处理浓度的升高而增加，并与叶片中的含水量、叶绿素含量、可溶性蛋白质含量和SOD酶活性相关系数分别为-0.6964、-0.9132、-0.3714和0.1483。结论：本实验克隆到的MYB转录因子属于MYBR1转录因子的CCA1-like/R-R亚族，被命为LhMYB1基因；该基因参与植株的干旱胁迫响应，此响应极有可能通过调节叶绿素合成而实现。