Surface sites for engineering allosteric control in proteins.
Surface sites for engineering allosteric control in proteins.
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DOI：
10.1126/science.1159052
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发表时间：
2008-10-17
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ranganathan R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lee J;Natarajan M;Nashine VC;Socolich M;Vo T;Russ WP;Benkovic SJ;Ranganathan R
蛋白质家族的统计分析揭示了共同进化的氨基酸网络，这些氨基酸在功能上连接了远距离定位的功能表面。这种连接提出了一种将变构控制工程化到蛋白质中的概念：两种蛋白质的分子内网络可以通过它们的表面位点连接，使得一种蛋白质的活性可以控制另一种蛋白质的活性。我们通过创建PAS-DHFR来测试这一想法，PAS-DHFR是一种设计的嵌合蛋白，其将来自Per/Arnt/Sim（PAS）蛋白家族的植物成员的光敏信号结构域与大肠杆菌二氢叶酸还原酶（DHFR）连接。在没有优化的情况下，PAS-DHFR表现出依赖于连接位点和两种蛋白质中已知的信号传导机制的光依赖性催化活性。PAS-DHFR作为通过在保守的变构位点处的界面设计将调节活性工程化到蛋白质中的概念验证。
Statistical analyses of protein families reveal networks of coevolving amino acids that functionally link distantly positioned functional surfaces. Such linkages suggest a concept for engineering allosteric control into proteins: The intramolecular networks of two proteins could be joined across their surface sites such that the activity of one protein might control the activity of the other. We tested this idea by creating PAS-DHFR, a designed chimeric protein that connects a light-sensing signaling domain from a plant member of the Per/Arnt/Sim (PAS) family of proteins with Escherichia coli dihydrofolate reductase (DHFR). With no optimization, PAS-DHFR exhibited light-dependent catalytic activity that depended on the site of connection and on known signaling mechanisms in both proteins. PAS-DHFR serves as a proof of concept for engineering regulatory activities into proteins through interface design at conserved allosteric sites.
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影响因子：
2.9
作者：
Harper, SM;Christie, JM;Gardner, KH
通讯作者：
Gardner, KH
影响因子：
64.5
作者：
Shulman, AI;Larson, C;Ranganathan, R
通讯作者：
Ranganathan, R
DOI：
10.1038/nsb881
发表时间：
2003-01-01
期刊：
NATURE STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
Süel, GM;Lockless, SW;Ranganathan, R
通讯作者：
Ranganathan, R
影响因子：
16
作者：
Peterson, FC;Penkert, RR;Prehoda, KE
通讯作者：
Prehoda, KE
影响因子：
2.9
作者：
Salomon, M;Christie, JM;Briggs, WR
通讯作者：
Briggs, WR