An online database for plant image analysis software tools.
An online database for plant image analysis software tools.
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DOI：
10.1186/1746-4811-9-38
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发表时间：
2013-10-09
期刊：
影响因子：
5.1
通讯作者：
Périlleux C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lobet G;Draye X;Périlleux C
近年来，使用图像分析进行植物表型鉴定的方法有所增加。这些方法需要新的软件解决方案来提取和处理数据。这些解决方案有助于支持各种研究渠道，从细胞化合物的定位到树冠的量化。然而，由于现有工具的多样性和缺乏中央存储库，研究人员很难确定最适合他们研究的软件。我们提出了一个在线的，手动管理的数据库，参考了90多种植物图像分析软件解决方案。该网站，PLANT-IMAGE-analysis.org，以统一和简明的方式展示了每个软件，使用户能够确定他们的实验需求的可用解决方案。该网站还支持用户反馈、评估和提交新软件。Org数据库提供了现有植物图像分析软件的概述。这样一个工具箱的目的是帮助用户找到解决方案，并为开发人员提供一种交流和沟通他们工作的方式。
Recent years have seen an increase in methods for plant phenotyping using image analyses. These methods require new software solutions for data extraction and treatment. These solutions are instrumental in supporting various research pipelines, ranging from the localisation of cellular compounds to the quantification of tree canopies. However, due to the variety of existing tools and the lack of central repository, it is challenging for researchers to identify the software that is best suited for their research. We present an online, manually curated, database referencing more than 90 plant image analysis software solutions. The website, plant-image-analysis.org, presents each software in a uniform and concise manner enabling users to identify the available solutions for their experimental needs. The website also enables user feedback, evaluations and new software submissions. The plant-image-analysis.org database provides an overview of existing plant image analysis software. The aim of such a toolbox is to help users to find solutions, and to provide developers a way to exchange and communicate about their work.
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通过X射线μ计算的断层扫描从土壤中恢复完整的植物根系体系。
影响因子：
5.1
作者：
Mairhofer S;Zappala S;Tracy S;Sturrock C;Bennett MJ;Mooney SJ;Pridmore TP
通讯作者：
Pridmore TP
影响因子：
5.4
作者：
Cobb, Joshua N.;DeClerck, Genevieve;Greenberg, Anthony;Clark, Randy;McCouch, Susan
通讯作者：
McCouch, Susan
影响因子：
2.5
作者：
Esser, Hanna G.;Carminati, Andrea;Oswald, Sascha E.
通讯作者：
Oswald, Sascha E.
影响因子：
7.4
作者：
Pound, Michael P.;French, Andrew P.;Pridmore, Tony
通讯作者：
Pridmore, Tony
影响因子：
5.1
作者：
Green JM;Appel H;Rehrig EM;Harnsomburana J;Chang JF;Balint-Kurti P;Shyu CR
通讯作者：
Shyu CR