Microprocessor mediates transcriptional termination of long noncoding RNA transcripts hosting microRNAs.
Microprocessor mediates transcriptional termination of long noncoding RNA transcripts hosting microRNAs.
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DOI：
10.1038/nsmb.2982
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发表时间：
2015-04
影响因子：
16.8
通讯作者：
Jopling, Catherine L.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dhir, Ashish;Dhir, Somdutta;Proudfoot, Nick J.;Jopling, Catherine L.
microRNA（miRNA）在基因表达的转录后调控中发挥着重要作用。哺乳动物miRNA的生物发生始于微处理器复合物对RNA聚合酶II（Pol II）转录物的共转录切割。虽然大多数miRNA位于蛋白质编码基因的内含子内，但相当少的miRNA来源于长非编码（lnc）RNA，其中转录物加工在很大程度上未被表征。我们通过对肝脏特异性lnc-pri-miR-122的详细表征和人类细胞系中的全基因组分析表明，大多数lnc-pri-miRNA不使用典型的切割和聚腺苷酸化（CPA）途径，而是使用微处理器切割来终止转录。这种微处理器失活导致lnc-pri-miRNA的广泛转录通读和对下游基因的转录干扰。因此，我们定义了一种新的RNase III介导的，多聚腺苷酸化独立的机制，在哺乳动物细胞中的Pol II转录终止。
MicroRNA (miRNA) play a major role in the post-transcriptional regulation of gene expression. Mammalian miRNA biogenesis begins with co-transcriptional cleavage of RNA polymerase II (Pol II) transcripts by the Microprocessor complex. While most miRNA are located within introns of protein coding genes, a substantial minority of miRNA originate from long non coding (lnc) RNA where transcript processing is largely uncharacterized. We show, by detailed characterization of liver-specific lnc-pri-miR-122 and genome-wide analysis in human cell lines, that most lnc-pri-miRNA do not use the canonical cleavage and polyadenylation (CPA) pathway, but instead use Microprocessor cleavage to terminate transcription. This Microprocessor inactivation leads to extensive transcriptional readthrough of lnc-pri-miRNA and transcriptional interference with downstream genes. Consequently we define a novel RNase III-mediated, polyadenylation-independent mechanism of Pol II transcription termination in mammalian cells.
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影响因子：
14.9
作者：
Flicek P;Amode MR;Barrell D;Beal K;Billis K;Brent S;Carvalho-Silva D;Clapham P;Coates G;Fitzgerald S;Gil L;Girón CG;Gordon L;Hourlier T;Hunt S;Johnson N;Juettemann T;Kähäri AK;Keenan S;Kulesha E;Martin FJ;Maurel T;McLaren WM;Murphy DN;Nag R;Overduin B;Pignatelli M;Pritchard B;Pritchard E;Riat HS;Ruffier M;Sheppard D;Taylor K;Thormann A;Trevanion SJ;Vullo A;Wilder SP;Wilson M;Zadissa A;Aken BL;Birney E;Cunningham F;Harrow J;Herrero J;Hubbard TJ;Kinsella R;Muffato M;Parker A;Spudich G;Yates A;Zerbino DR;Searle SM
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Searle SM
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