PreDs: a server for predicting dsDNA-binding site on protein molecular surfaces
PreDs: a server for predicting dsDNA-binding site on protein molecular surfaces
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DOI：
10.1093/bioinformatics/bti232
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发表时间：
2005-04-15
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Nakamura, H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tsuchiya, Y;Kinoshita, K;Nakamura, H
PreDs是一个WWW服务器，它预测蛋白质分子表面上的dsDNA结合位点，这些位点是以PDB格式从原子坐标生成的。通过计算表面上的静电势、局部曲率和全局曲率来进行预测。预测结果可以通过我们的原始曲面查看器进行交互式检查。
PreDs is a WWW server that predicts the dsDNA-binding sites on protein molecular surfaces generated from the atomic coordinates in a PDB format. The prediction was done by evaluating the electrostatic potential, the local curvature and the global curvature on the surfaces. Results of the prediction can be interactively checked with our original surface viewer.