宏转录组测序揭示褐土脲酶基因的表达丰度和细菌来源
宏转录组测序揭示褐土脲酶基因的表达丰度和细菌来源
复制标题
DOI：
10.16135/j.issn1002-0861.2019.0538
复制
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
宋纪真
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
胡利伟;轩贝贝;戴华鑫;郭建华;牟文君;刘阳;翟振;闫鼎;蔡宪杰;奚家勤;薛超群;宋纪真
为明确褐土中脲酶编码基因的表达丰度,通过土壤RNA提取和宏转录组测序法,筛选RNA水平上表达较高的脲酶基因,共筛选到122个脲酶结构基因(93个ureC、16个ureB和13个ureA)和脲酶辅助基因115个(29个ureD、12个ureE、36个ureF、29个ureG、5个ureH和4个ureJ)。其中ureB、ureA、ureG、ureH和ureJ所有转录本TPM值都小于2,而ureC、ureD、ureE和ureF丰度最高的转录本TPM值分别为3.17、 5.37、2.01和2.71。细菌来源的芽孢杆菌属Bacillus、芽孢八叠球菌属Sporosarcina、节杆菌属Arthrobacter、链霉属Streptomyces和类芽孢杆菌属Paenibacillus等在褐土脲酶活性的发挥中贡献度较大。