Aspherical-atom scattering factors from molecular wave functions. 1. Transferability and conformation dependence of atomic electron densities of peptides within the multipole formalism.
Aspherical-atom scattering factors from molecular wave functions. 1. Transferability and conformation dependence of atomic electron densities of peptides within the multipole formalism.
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来自分子波函数的非球面原子散射因子。
DOI：
10.1107/s0108767302010991
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发表时间：
2002
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Coppens,Philip
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Koritsanszky,Tibor;Volkov,Anatoliy;Coppens,Philip
在这项研究中，讨论了建立适用于生物大分子密度构建和X射线衍射数据解释的理论原子变形密度参数数据库的可行性。所描述的过程涉及根据 B3LYP 水平的理论密度计算生成三肽的仅价结构因子，并根据这些模拟数据细化多极参数。到目前为止，我们的结果表明，以这种方式提取的主链假原子具有高度可转移性，并且相对于肽框架中单键的旋转具有相当的不变性。最终目标是使用非球面原子数据库来改进基于高分辨率数据的大分子细化，并预测较大分子的静电特性。
In this study, the feasibility of building a database of theoretical atomic deformation density parameters applicable to the construction of the densities of biomacromolecules and to the interpretation of their X-ray diffraction data is discussed. The procedure described involves generation of valence-only structure factors of tripeptides calculated from theoretical densities at the B3LYP level and the refinement of multipole parameters against these simulated data. Our results so far indicate that the backbone pseudoatoms extracted in such a way are highly transferable and fairly invariant with respect to rotations around single bonds in the peptide framework. The ultimate goal is to use the aspherical-atom database for improved macromolecular refinements that are based on high-resolution data and for prediction of electrostatic properties of larger molecules.
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建立适用于多肽的可迁移实验电子密度参数数据库
DOI：
10.1021/j100016a071
发表时间：
1995
期刊：
The Journal of Physical Chemistry
影响因子：
--
作者：
V. Pichon;C. Lecomte;H. Lachekar
通讯作者：
H. Lachekar
影响因子：
2.8
作者：
KOCH, U;POPELIER, PLA;STONE, AJ
通讯作者：
STONE, AJ
分子间相互作用对多极细化电子密度的影响。
DOI：
10.1107/s0108767398007181
发表时间：
1999
期刊：
Acta crystallographica. Section A, Foundations of crystallography
影响因子：
--
作者：
M. Spackman;P. G. Byrom;Maria Alfredsson;K. Hermansson
通讯作者：
K. Hermansson
从头开始晶体计算的 X 射线电荷密度细化的密度优化径向指数。
DOI：
10.1107/s0108767300018547
发表时间：
2001
期刊：
Acta crystallographica. Section A, Foundations of crystallography
影响因子：
--
作者：
A. Volkov;Y. Abramov;P. Coppens
通讯作者：
P. Coppens
高斯轨道积的傅里叶变换
DOI：
10.1107/s0567739478000613
发表时间：
1978
期刊：
Acta Crystallographica Section A
影响因子：
--
作者：
G. Chandler;M. Spackman
通讯作者：
M. Spackman