Molecular simulations of carbohydrates and protein-carbohydrate interactions: motivation, issues and prospects.
Molecular simulations of carbohydrates and protein-carbohydrate interactions: motivation, issues and prospects.
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DOI：
10.1016/j.drudis.2010.06.001
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发表时间：
2010-08
影响因子：
7.4
通讯作者：
Woods, Robert J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fadda, Elisa;Woods, Robert J.
寡糖、其缀合物和类似物的3D结构的表征对于传统的实验方法特别具有挑战性。分子模拟方法为解释稀疏的实验数据和独立预测聚糖的构象和动力学性质提供了基础。在这里，我们总结和分析了与建模碳水化合物相关的问题，详细讨论了四个最近开发的碳水化合物力场，回顾了天然聚糖，碳水化合物-蛋白质复合物和糖模拟药物的新兴领域的适用性。此外，我们还讨论了碳水化合物模型在药物发现中的应用前景。
The characterization of the 3D structure of oligosaccharides, their conjugates and analogs is particularly challenging for traditional experimental methods. Molecular simulation methods provide a basis for interpreting sparse experimental data and for independently predicting conformational and dynamic properties of glycans. Here, we summarize and analyze the issues associated with modeling carbohydrates, with a detailed discussion of four of the most recently developed carbohydrate force fields, reviewed in terms of applicability to natural glycans, carbohydrate–protein complexes and the emerging area of glycomimetic drugs. In addition, we discuss prospectives and new applications of carbohydrate modeling in drug discovery.
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--
作者：
Durier, V;Tristram, F;Vergoten, G
通讯作者：
Vergoten, G
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作者：
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