以玉竹为例探讨含多糖中药网络药理学研究
以玉竹为例探讨含多糖中药网络药理学研究
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DOI：
10.11842/wst.20210730009
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
杨华生
中科院分区：
文献类型：
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作者：
柳婷;邓碧莲;李婷;欧阳征海;吴璐;杨华生
目的以玉竹为例探讨含多糖成分中药网络药理学的研究方法。方法采用TCMSP(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)、Batman-TCM(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm)等数据库搜索玉竹活性成分,以OB(oral bioavailability,OB)≥30%、DL(drug likeness,DL)≥0.18为筛选阈值,构建"玉竹"成分库;在此基础上,加入玉竹多糖与肠道菌群作用的产物"短链脂肪酸"(short chain fatty acids,SCFAs),构建"玉竹+ SCFAs"成分库。收集"玉竹""玉竹+SCFAs"两成分库中的成分的对应靶点,建立成分靶点库。以"糖尿病"(diabetes)为主治病症,建立疾病靶点库。然后分别取"玉竹"成分靶点、"玉竹+SCFAs"成分靶点与疾病靶点的交集,再对两交集靶点进行PPI(protein protein interaction,PPI)、GO(gene ontology,GO)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析,并比较两者的异同。以高糖高脂饮食诱导,腹腔注射链脲佐菌素建立2型糖尿病大鼠模型,造模成功后灌胃给予玉竹多糖,采用qRT-PCR方法检测肾组织中CTNNB1、RAP1B的表达。结果"玉竹"成分库共有9个成分,在此基础上增加乙酸、丙酸、丁酸,得到"玉竹+SCFAs"成分库;"玉竹+SCFAs"成分靶点与糖尿病靶点的交集靶点为113个,而"玉竹"成分靶点与糖尿病靶点的交集靶点为94个。PPI分析显示,与"玉竹"比较,"玉竹+SCFAs"不仅增加了SRC、AKT1、PIK3CA等Hub蛋白的度值;同时,排名前10的Hub蛋白还增加了CTNNB1。GO分析显示,"玉竹+SCFAs"治疗糖尿病的细胞定位主要涉及细胞膜、细胞外,而"玉竹"的细胞定位主要涉及细胞膜、细胞核。KEGG分析显示,与"玉竹"比较,"玉竹+SCFAs"归属于RAP1信号通路的靶点数增加,同时P值减小。实验验证结果显示,与模型组比较,玉竹多糖可显著降低CTNNB1及RAP1B的表达。结论该研究建立的网络药理学不仅关注小分子成分,同时关注大分子成分,研究结果为含有多糖中药的网络药理学研究提供了新视角。