含磷嘧啶类CDK9抑制剂的分子对接、3D-QSAR和分子动力学模拟

含磷嘧啶类CDK9抑制剂的分子对接、3D-QSAR和分子动力学模拟
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DOI:
10.7503/cjcu20170237
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发表时间:
2017-10
期刊:
高等学校化学学报
影响因子:
--
通讯作者:
王远强
王远强
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
唐光辉;张娅;张玉萍;周朋朋;林治华;王远强

文献摘要

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选取64个具有潜力的含磷嘧啶类细胞周期依赖性蛋白激酶(CDK9)小分子抑制剂,采用分子对接方法研究了该类小分子与CDK9的结合作用,结果表明,分子构象、氢键形成、疏水性和氨基酸残基Cys106在此类抑制剂与CDK9的结合过程中具有重要作用. 在配体叠合的基础上,运用比较分子力场分析(CoMFA)、比较分子相似性指数分析(CoMSIA)和Topomer CoMFA(T-COMFA)研究了分子结构与抑制活性的关系,发现由训练集立体场、静电场和疏水场组合的CoMSIA模型为最优模型,其内部交叉验证相关系数( Q