肝郁证青光眼大鼠视网膜miRNA表达特征及生物信息学分析
肝郁证青光眼大鼠视网膜miRNA表达特征及生物信息学分析
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DOI：
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
孙河
中科院分区：
文献类型：
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作者：
王丽媛;于天洋;董霏雪;赵爽;樊晓瑞;孙河
目的:观察肝郁证青光眼大鼠视网膜微小核糖核酸(miRNA)的表达特征,探究肝郁证青光眼的发生机制。方法:将24只雄性SD大鼠随机分为空白组、青光眼组和肝郁证青光眼组,每组8只。青光眼组采用巩膜上静脉高渗盐水注射制作青光眼大鼠模型,肝郁证青光眼组采用慢性不可预知性温和应激刺激制作肝郁模型,造模成功后再进行慢性青光眼模型的制备。通过旷场实验检测大鼠肝郁证造模情况,采用Tono-pen avia笔式眼压计检测模型大鼠眼压,造模成功2周后,收集大鼠视网膜组织,采用HE染色观察视网膜组织形态学变化,提取视网膜总RNA,进行miRNA芯片检测,借助TargetScan、miRanda、miRBase数据库得到差异表达miRNA的靶基因;利用DAVID数据库和KEGG数据库进行富集分析;采用Cytoscape 3.7.1软件构建miRNA-mRNA网络。结果:本研究成功构建肝郁证青光眼大鼠模型,经miRNA芯片检测发现,与空白组比较,肝郁证青光眼组差异表达的miRNA共11个(上调2个,下调9个);与青光眼组比较,肝郁证青光眼组差异表达的miRNA共18个(上调1个,下调17个);与肝郁证青光眼特异相关的差异miRNA包括miR-133b-5p、miR-1843a-3p、miR-347等。富集分析显示,差异表达miRNA的靶基因主要富集在细胞黏附、血管生成、神经元凋亡等生物过程,集中在细胞质膜、高尔基体、突触等细胞组分中,涉及磷脂酰肌醇结合、GDP结合等分子功能及cGMP-PKG、cAMP等信号通路上。miRNA-mRNA网络显示,差异表达miRNA对应BDNF、mTOR等靶基因。结论:肝郁证青光眼模型大鼠视网膜组织中差异性表达的miRNA可能通过影响相关生物过程、分子功能和信号通路调控BDNF、mTOR等靶基因,影响肝郁证青光眼的发生发展。