Single-cell genome-wide bisulfite sequencing for assessing epigenetic heterogeneity.
Single-cell genome-wide bisulfite sequencing for assessing epigenetic heterogeneity.
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DOI：
10.1038/nmeth.3035
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发表时间：
2014-08
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Kelsey, Gavin
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Smallwood, Sebastien A.;Lee, Heather J.;Angermueller, Christof;Krueger, Felix;Saadeh, Heba;Peet, Julian;Andrews, Simon R.;Stegle, Oliver;Reik, Wolf;Kelsey, Gavin
我们报告了一种单细胞亚硫酸氢盐测序方法（scBS-Seq），能够准确测量高达48.4%的CpG的DNA甲基化。我们观察到在血清或2 i中生长的ESC都显示出表观遗传异质性，血清培养物中存在“2 i样”细胞。12个小鼠卵母细胞数据集的计算机集成在很大程度上概括了整个DNA甲基化组，使scBS-Seq成为探索稀有细胞和异质群体中DNA甲基化的通用工具。
We report a single-cell bisulfite sequencing method (scBS-Seq) capable of accurately measuring DNA methylation at up to 48.4% of CpGs. We observed that ESCs grown in serum or 2i both display epigenetic heterogeneity, with “2i-like” cells present in serum cultures. In silico integration of 12 individual mouse oocyte datasets largely recapitulates the whole DNA methylome, making scBS-Seq a versatile tool to explore DNA methylation in rare cells and heterogeneous populations.
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DOI：
10.1126/science.1247651
发表时间：
2014-02-14
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Jaitin DA;Kenigsberg E;Keren-Shaul H;Elefant N;Paul F;Zaretsky I;Mildner A;Cohen N;Jung S;Tanay A;Amit I
通讯作者：
Amit I
影响因子：
23.9
作者：
Hayashi K;de Sousa Lopes SMC;Tang F;Lao K;Surani MA
通讯作者：
Surani MA
影响因子：
30.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
64.8
作者：
Chambers, Ian;Silva, Jose;Smith, Austin
通讯作者：
Smith, Austin
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--