Functional Metagenomics to Study Antibiotic Resistance
Functional Metagenomics to Study Antibiotic Resistance
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DOI：
10.1007/978-1-4939-6634-9_19
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发表时间：
2017-01-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Dantas, Gautam
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Boolchandani, Manish;Patel, Sanket;Dantas, Gautam
宏基因组表达文库的构建和筛选对于鉴定新基因及其功能具有巨大的潜力。在这里，我们描述了从粪便 DNA 中制备宏基因组文库、筛选抗生素抗性基因 (ARG) 文库、对富集 DNA 片段进行大规模并行 DNA 测序，以及用于功能选择 DNA 的高通量组装和注释的计算流程。
The construction and screening of metagenomic expression libraries has great potential to identify novel genes and their functions. Here, we describe metagenomic library preparation from fecal DNA, screening of libraries for antibiotic resistance genes (ARGs), massively parallel DNA sequencing of the enriched DNA fragments, and a computational pipeline for high-throughput assembly and annotation of functionally selected DNA.