ConKit: a python interface to contact predictions.
ConKit: a python interface to contact predictions.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btx148
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发表时间：
2017-07-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Rigden DJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Simkovic F;Thomas JMH;Rigden DJ
蛋白质残基接触预测算法的最新进展导致了许多新方法和各种文件格式的出现。我们提出了ConKit，一个开源的，模块化的和可扩展的Python接口，它允许格式之间的轻松转换，并提供了一个接口来分析序列比对和接触预测集。 ConKit可以通过Python包索引获得。文档可以在http://www.conkit.org上找到。ConKit是根据BSD 3条款许可的。 补充数据可在Bioinformatics在线获得。
Recent advances in protein residue contact prediction algorithms have led to the emergence of many new methods and a variety of file formats. We present ConKit, an open source, modular and extensible Python interface which allows facile conversion between formats and provides an interface to analyses of sequence alignments and sets of contact predictions. ConKit is available via the Python Package Index. The documentation can be found at http://www.conkit.org. ConKit is licensed under the BSD 3-Clause. Supplementary data are available at Bioinformatics online.
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DOI：
10.1107/s0907444910045749
发表时间：
2011-04
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Winn MD;Ballard CC;Cowtan KD;Dodson EJ;Emsley P;Evans PR;Keegan RM;Krissinel EB;Leslie AG;McCoy A;McNicholas SJ;Murshudov GN;Pannu NS;Potterton EA;Powell HR;Read RJ;Vagin A;Wilson KS
通讯作者：
Wilson KS
影响因子：
7.7
作者：
Ovchinnikov S;Kamisetty H;Baker D
通讯作者：
Baker D
影响因子：
64.5
作者：
Hopf TA;Colwell LJ;Sheridan R;Rost B;Sander C;Marks DS
通讯作者：
Marks DS
Biopython：用于计算分子生物学和生物信息学的免费 Python 工具。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp163
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Cock PJ;Antao T;Chang JT;Chapman BA;Cox CJ;Dalke A;Friedberg I;Hamelryck T;Kauff F;Wilczynski B;de Hoon MJ
通讯作者：
de Hoon MJ
影响因子：
2.9
作者：
Parente DJ;Ray JC;Swint-Kruse L
通讯作者：
Swint-Kruse L