Increased mortality in community-tested cases of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7.
Increased mortality in community-tested cases of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7.
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DOI：
10.1038/s41586-021-03426-1
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发表时间：
2021-05
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
SARS-CoV-2谱系B.1.1.7是2020年9月在英国首次发现的一种变异病毒，目前已传播至全球多个国家。一些研究已经确定B.1.1.7比先前存在的变体更具传播性，但尚未确定它是否会导致疾病严重程度的任何变化。在这里，我们分析了一个数据集，该数据集将2020年11月1日至2021年2月14日英格兰2，245，263例SARS-CoV-2阳性社区检测和17，452例与COVID-19相关的死亡联系起来。对于这些检测中的1，146，534（51%）例，可以确定是否存在B.1.1.7，因为该谱系中的突变阻止了S基因靶标的PCR扩增（称为S基因靶标失效（SGTF））。基于已知SGTF状态的4，945例死亡，我们估计在调整年龄、性别、种族、贫困、居住在护理院、当地居住当局和检测日期后，SGTF相关死亡风险比无SGTF的病例高55%（95%置信区间，39-72%）。这对应于在社区中阳性检测的28天内，55-69岁男性的绝对死亡风险从0.6%增加到0.9%（95%置信区间，0.8-1.0%）。校正SGTF的错误分类和SGTF状态的缺失，我们估计与B.1.1.7相关的死亡风险比预先存在的变体高61%（42-82%）。我们的分析表明，B.1.1.7不仅比先前存在的SARS-CoV-2变体更具传播性，而且还可能导致更严重的疾病。
SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7, a variant that was first detected in the UK in September 2020, has spread to multiple countries worldwide. Several studies have established that B.1.1.7 is more transmissible than pre-existing variants, but have not identified whether it leads to any change in disease severity. Here we analyse a dataset that links 2,245,263 positive SARS-CoV-2 community tests and 17,452 deaths associated with COVID-19 in England from 1 November 2020 to 14 February 2021. For 1,146,534 (51%) of these tests, the presence or absence of B.1.1.7 can be identified because mutations in this lineage prevent PCR amplification of the spike (S) gene target (known as S gene target failure (SGTF)). On the basis of 4,945 deaths with known SGTF status, we estimate that the hazard of death associated with SGTF is 55% (95% confidence interval, 39–72%) higher than in cases without SGTF after adjustment for age, sex, ethnicity, deprivation, residence in a care home, the local authority of residence and test date. This corresponds to the absolute risk of death for a 55–69-year-old man increasing from 0.6% to 0.9% (95% confidence interval, 0.8–1.0%) within 28 days of a positive test in the community. Correcting for misclassification of SGTF and missingness in SGTF status, we estimate that the hazard of death associated with B.1.1.7 is 61% (42–82%) higher than with pre-existing variants. Our analysis suggests that B.1.1.7 is not only more transmissible than pre-existing SARS-CoV-2 variants, but may also cause more severe illness.
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SARS-COV-2血统的估计可传播和影响B.1.1.7在英国。
DOI：
10.1126/science.abg3055
发表时间：
2021-04-09
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Davies NG;Abbott S;Barnard RC;Jarvis CI;Kucharski AJ;Munday JD;Pearson CAB;Russell TW;Tully DC;Washburne AD;Wenseleers T;Gimma A;Waites W;Wong KLM;van Zandvoort K;Silverman JD;CMMID COVID-19 Working Group;COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium;Diaz-Ordaz K;Keogh R;Eggo RM;Funk S;Jit M;Atkins KE;Edmunds WJ
通讯作者：
Edmunds WJ
与SARS-COV-2谱系感染有关的住院风险B.1.1.7在丹麦：一项观察队列研究。
DOI：
10.1016/s1473-3099(21)00290-5
发表时间：
2021-11
期刊：
The Lancet. Infectious diseases
影响因子：
--
作者：
Bager P;Wohlfahrt J;Fonager J;Rasmussen M;Albertsen M;Michaelsen TY;Møller CH;Ethelberg S;Legarth R;Button MSF;Gubbels S;Voldstedlund M;Mølbak K;Skov RL;Fomsgaard A;Krause TG;Danish Covid-19 Genome Consortium
通讯作者：
Danish Covid-19 Genome Consortium
影响因子：
2
作者：
Lumley, Thomas;Scott, Alastair
通讯作者：
Scott, Alastair
影响因子：
3.9
作者：
Argimón S;Abudahab K;Goater RJE;Fedosejev A;Bhai J;Glasner C;Feil EJ;Holden MTG;Yeats CA;Grundmann H;Spratt BG;Aanensen DM
通讯作者：
Aanensen DM
DOI：
10.1136/bmj.n579
发表时间：
2021-03-09
期刊：
BMJ (Clinical research ed.)
影响因子：
--
作者：
Challen R;Brooks-Pollock E;Read JM;Dyson L;Tsaneva-Atanasova K;Danon L
通讯作者：
Danon L