Genomic effects of polyamide/DNA interactions on mRNA expression.

Genomic effects of polyamide/DNA interactions on mRNA expression.
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聚酰胺/DNA 相互作用对 mRNA 表达的基因组影响。

DOI:
10.1016/s1074-5521(02)00174-6
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发表时间:
2002
影响因子:
--
通讯作者:
Wemmer,DavidE
Wemmer,DavidE
中科院分区:
生物1区
文献类型:
--
作者:
Supekova,Lubica;Pezacki,JohnPaul;Su,AndrewI;Loweth,ColinJ;Riedl,Rainer;Geierstanger,Bernhard;Schultz,PeterG;Wemmer,DavidE

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参考文献

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在这里,我们的生物活性的发夹聚酰胺1,抑制结合小沟转录因子LEF-1,组成型表达在结肠癌。用1处理的DLD 1结肠癌细胞中mRNA表达的全基因组分析显示,有限数量的基因受到影响;最显著的变化对应于与细胞周期、信号传导和蛋白水解相关的基因,而不是预期的WNT信号传导途径。经处理的细胞表现出倍增时间增加和对DNA损伤的超敏反应,这很可能是由于DNA损伤检查点基因(包括YWAE(14-3-3 β蛋白)和DDIT 3)的下调。基因组水平上的启动子分析揭示了许多潜在的聚酰胺结合位点和多种可能的转录拮抗机制,强调了基因表达谱在理解聚酰胺在细胞水平上对转录的影响方面的实用性。
Here we characterize the biological activity of a hairpin polyamide 1 that inhibits binding of the minor-groove transcription factor LEF-1, constitutively expressed in colon cancers. Genome-wide analysis of mRNA expression in DLD1 colon cancer cells treated with 1 reveals that a limited number of genes are affected; the most significant changes correspond to genes related to cell cycle, signaling, and proteolysis rather than the anticipated WNT signaling pathway. Treated cells display increased doubling time and hypersensitivity to DNA damage that most likely results from downregulation of DNA-damage checkpoint genes, including YWAE (14-3-3ϵ protein) and DDIT3. Promoter analyses on a genomic level revealed numerous potential polyamide binding sites and multiple possible mechanisms for transcriptional antagonism, underscoring the utility of gene expression profiling in understanding the effects of polyamides on transcription at the cellular level.
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DOI: --
发表时间: 2001
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作者:
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Jiangchun Xu;J. Stolk;Xinqun Zhang;Sandra J. Silva;Raymond L. Houghton;Masazumi Matsumura;T. Vedvick;Kevin B. Leslie;Roberto Badaró;Steven G. Reed
通讯作者: Jiangchun Xu;J. Stolk;Xinqun Zhang;Sandra J. Silva;Raymond L. Houghton;Masazumi Matsumura;T. Vedvick;Kevin B. Leslie;Roberto Badaró;Steven G. Reed
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