Initiator titration complex formed at datA with the aid of IHF regulates replication timing in Escherichia coli
Initiator titration complex formed at datA with the aid of IHF regulates replication timing in Escherichia coli
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借助 IHF 在 datA 上形成的引发滴定复合物调节大肠杆菌中的复制时间
DOI：
10.1111/j.1365-2443.2008.01269.x
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发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
2.1
通讯作者：
T. Ogawa
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shingo Nozaki;Yoshitaka Yamada;T. Ogawa
大肠杆菌中复制的起始受称为“起始滴定”的机制负控制，该机制是起始蛋白DnaA滴定至染色体上新复制的结合序列以降低复制起始潜力的过程。引发剂滴定主要发生在datA位点，其结合异常大量的DnaA分子以防止异常引发。我们发现，这是通过整合宿主因子（IHF）实现的。在datA内，两个DnaA识别序列（DnaA盒）之间存在对其功能至关重要的共识IHF识别序列。在体外和体内都证明了IHF与该位点的结合。如在ΔdatA细胞中观察到的，IHF结合共有区中核心序列的破坏导致起始浓度增加。此外，在IHF结合核心序列中携带破坏的细胞中，与datA结合的DnaA分子的数量减少。IHF结合位点和必要的DnaA盒必须位于适当的距离和方向，以保持准确的起始时间。因此，IHF是控制复制起始的独特元件，其在datA处起负作用，而已知在oriC处起正调节剂作用。
The initiation of replication in Escherichia coli is negatively controlled by a mechanism referred to as ‘initiator titration’, a process by which the initiator protein, DnaA, is titrated to newly replicated binding sequences on the chromosome to reduce the initiation potential for replication. Initiator titration occurs predominantly at the datA locus that binds exceptionally large amounts of DnaA molecules to prevent aberrant initiations. We found that this was enabled by integration host factor (IHF). Within datA, there is a consensus IHF recognition sequence between the two DnaA recognition sequences (DnaA boxes) essential for its function. Binding of IHF to this site was demonstrated both in vitro and in vivo. Disruption of the core sequence in the consensus of the IHF‐binding resulted in increased origin concentration as observed in ΔdatA cells. Furthermore, the number of DnaA molecules bound to datA was reduced in cells carrying a disruption in the IHF‐binding core sequence. The IHF‐binding site and the essential DnaA boxes had to be located at a proper distance and orientation to maintain the accurate initiation timing. Therefore, IHF is a unique element in the control of replication initiation that acts negatively at datA, while known to act as a positive regulator at oriC.
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Roll,J
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Polaczek,P