Structure of an inactive conformation of GTP-bound RhoA GTPase.
Structure of an inactive conformation of GTP-bound RhoA GTPase.
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DOI：
10.1016/j.str.2020.12.015
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发表时间：
2021-06-03
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Zheng Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lin Y;Lu S;Zhang J;Zheng Y
通过使用 31P NMR，我们证明 Rho 家族 GTP 酶 RhoA 与 Ras GTP 酶一样，在与 GTP 结合时存在构象平衡。与 GTP 类似物 GMPPNP 和 GDP 结合的 RhoA 的高分辨率晶体结构表明，它们表现出相似的整体非活性构象。与先前报道的两种 RhoA 主要活性突变体（G14V 和 Q63L）的 GTP 类似物结合形式的晶体结构相反，GMPPNP 结合的 RhoA 在 Switch I 环中呈现开放构象，并且 γ-磷酸盐和 Pro36（而不是典型的 Thr37）之间存在先前未见的相互作用。分子动力学模拟发现，致癌的 RhoAG14V 突变体在开关区域显示出较低的灵活性，这与 GDP 结合的 RhoAG14V 的晶体结构一致。因此，GDP 和 GTP 结合的 RhoA 可以呈现类似的非活性构象，并且 Switch 区域中的分子动力学可能在 RhoA 激活中发挥作用。林等人。证明 RhoA-GTP 以非活性构象存在，其中 RhoA 的晶体结构与 GTP 类似物 GMPPNP 结合。 Switches I 和 II 区域的固有动态对于 RhoA 激活非常重要，并受到致癌突变 G14V 的调节。
By using 31P NMR, we present evidence that the Rho family GTPase RhoA, like Ras GTPases, exists in an equilibrium of conformations when bound to GTP. High resolution crystal structures of RhoA bound to the GTP analog GMPPNP and to GDP show that they display a similar overall inactive conformation. In contrast to the previously reported crystal structures of GTP-analog bound form of two RhoA dominantly active mutants (G14V and Q63L), GMPPNP-bound RhoA assumes an open conformation in the Switch I loop with a previously unseen interaction between the γ-phosphate and Pro36, instead of the canonical Thr37. Molecular dynamics simulations found that the oncogenic RhoAG14V mutant displays a reduced flexibility in the Switch regions, consistent with a crystal structure of GDP-bound RhoAG14V. Thus, GDP- and GTP-bound RhoA can present similar inactive conformations, and the molecular dynamics in the Switch regions are likely to have a role in RhoA activation. Lin et al. demonstrate that RhoA-GTP exists in an inactive conformation with a crystal structure of RhoA bound to the GTP analog GMPPNP. Inherent dynamics in the Switches I & II regions are important for RhoA activation and are modulated by the oncogenic mutation G14V.
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DOI：
10.1107/s090744491003982x
发表时间：
2011-04
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Evans PR
通讯作者：
Evans PR
影响因子：
30.8
作者：
Krauthammer, Michael;Kong, Yong;Ha, Byung Hak;Evans, Perry;Bacchiocchi, Antonella;McCusker, James P.;Cheng, Elaine;Davis, Matthew J.;Goh, Gerald;Choi, Murim;Ariyan, Stephan;Narayan, Deepak;Dutton-Regester, Ken;Capatana, Ana;Holman, Edna C.;Bosenberg, Marcus;Sznol, Mario;Kluger, Harriet M.;Brash, Douglas E.;Stern, David F.;Materin, Miguel A.;Lo, Roger S.;Mane, Shrikant;Ma, Shuangge;Kidd, Kenneth K.;Hayward, Nicholas K.;Lifton, Richard P.;Schlessinger, Joseph;Boggon, Titus J.;Halaban, Ruth
通讯作者：
Halaban, Ruth
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
5.7
作者：
Buhrman, Greg;Wink, Glenna;Mattos, Carla
通讯作者：
Mattos, Carla
影响因子：
16.6
作者：
Long, Dong;Marshall, Christopher B.;Kay, Lewis E.
通讯作者：
Kay, Lewis E.