Best practices in bioinformatics training for life scientists.
Best practices in bioinformatics training for life scientists.
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生命科学家的生物信息学培训中的最佳实践。
DOI：
10.1093/bib/bbt043
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发表时间：
2013-09
影响因子：
9.5
通讯作者：
Attwood TK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Via A;Blicher T;Bongcam-Rudloff E;Brazas MD;Brooksbank C;Budd A;De Las Rivas J;Dreyer J;Fernandes PL;van Gelder C;Jacob J;Jimenez RC;Loveland J;Moran F;Mulder N;Nyrönen T;Rother K;Schneider MV;Attwood TK
现代高通量生物学新领域产生的海量数据正在不可逆转地改变生物医学研究，并对数据管理和操作以及数据挖掘和分析方面的培训产生近乎无法满足的需求。在生命科学家中，从临床医生到环境研究人员，一个共同的主题是不仅需要使用和熟悉生物信息学工具和资源，而且还需要了解其潜在的基本理论和实践概念。提供生物信息学培训，使生命科学家能够有效地处理和分析他们的数据，并推进他们的研究，是全球面临的一项挑战。提供良好的培训超越了传统的讲座和以资源为中心的演示，利用互动性、解决问题的练习和合作学习来大幅提高培训质量和学习成果。在此背景下，本文讨论了用于确定培训需求和学习目标、选择合适的学员和培训师、发展和维持培训技能以及评估培训质量的各种实用标准。遵守这些标准不仅有助于指导课程组织者和培训师走向卓越的生物信息学培训之路，而且重要的是，还可以改善生命科学家的培训体验。
The mountains of data thrusting from the new landscape of modern high-throughput biology are irrevocably changing biomedical research and creating a near-insatiable demand for training in data management and manipulation and data mining and analysis. Among life scientists, from clinicians to environmental researchers, a common theme is the need not just to use, and gain familiarity with, bioinformatics tools and resources but also to understand their underlying fundamental theoretical and practical concepts. Providing bioinformatics training to empower life scientists to handle and analyse their data efficiently, and progress their research, is a challenge across the globe. Delivering good training goes beyond traditional lectures and resource-centric demos, using interactivity, problem-solving exercises and cooperative learning to substantially enhance training quality and learning outcomes. In this context, this article discusses various pragmatic criteria for identifying training needs and learning objectives, for selecting suitable trainees and trainers, for developing and maintaining training skills and evaluating training quality. Adherence to these criteria may help not only to guide course organizers and trainers on the path towards bioinformatics training excellence but, importantly, also to improve the training experience for life scientists.
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