Environmental DNA monitoring method of the commercially important and endangered fish Gnathopogon caerulescens
Environmental DNA monitoring method of the commercially important and endangered fish Gnathopogon caerulescens
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商业重要濒危鱼类Gnathopogon caerulescens的环境DNA监测方法
DOI：
10.1007/s10201-021-00665-z
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发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
1.6
通讯作者：
Tani Katsuji
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Uchii Kimiko;Wakimura Kei;Kikko Takeshi;Yonekura Ryuji;Kawaguchi Riho;Komada Honoka;Yamanaka Hiroki;Kenzaka Takehiko;Tani Katsuji
日本琵琶湖中的 Gnathopogon caerulescensis 是一种濒临灭绝但具有重要商业价值的鱼类。 G. 人口规模过去几十年来，蓝藻数量急剧减少，因此迫切需要制定有效的资源管理框架，以实现该物种的可持续利用。在濒危物种的管理中，监测和掌握其分布和丰度非常重要。尽管出于此目的通常采用基于捕捞的方法，但这些方法需要更多的劳动力和时间，并且可能损害濒危物种的种群。在这项研究中，我们的目标是开发一种快速、非侵入性的 G 监测工具。 caerulescens 使用基于环境 DNA 的方法。我们开发了一种实时 PCR 检测方法，专门检测和定量 G。 caerulescensDNA 并应用开发的测定法来监测 G 的浓度。琵琶湖水中的蓝藻DNA。 G 的动力学. caerulescensDNA浓度很好地再现了蓝藻生活史的主要特征。 caerulescens，表明有希望使用基于环境 DNA 的方法来监测该物种的分布和丰度。
Gnathopogon caerulescensis an endangered but commercially important fish in Lake Biwa, Japan. The population size ofG. caerulescenshas drastically reduced in the past decades, and there is a strong need to develop effective resource management frameworks for the sustainable use of this species. In the management of endangered species, it is important to monitor and grasp their distribution and abundance. Although catch-based methods have generally been employed for this purpose, these methods require more labor and time and can damage the populations of endangered species. In this study, we aimed to develop a rapid and non-invasive monitoring tool forG. caerulescensusing an environmental DNA-based approach. We developed a real-time PCR assay that specifically detects and quantifiesG. caerulescensDNA and applied the developed assay to monitor the concentrations ofG. caerulescensDNA in water in Lake Biwa. The dynamics ofG. caerulescensDNA concentrations well reproduced the main characteristics of life history ofG. caerulescens, suggesting the promising use of environmental DNA-based methods for monitoring the distribution and abundance of this species.
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