Displacement statistics of unhindered single molecules show no enhanced diffusion in enzymatic reactions

Displacement statistics of unhindered single molecules show no enhanced diffusion in enzymatic reactions
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不受阻碍的单分子的位移统计显示酶反应中的扩散没有增强

DOI:
10.1101/2021.07.20.452795
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发表时间:
2021
期刊:
bioRxiv
影响因子:
--
通讯作者:
Ke Xu
Ke Xu
中科院分区:
--
文献类型:
--
作者:
Alexander A Choi;Ha H. Park;Kun Chen;Rui Yan;Wan Li;Ke Xu

文献摘要

参考文献

被引文献

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最近的研究引发了关于催化反应是否会提高酶的扩散系数 D 的激烈争论。通过对在普通缓冲液中自由扩散的不受阻碍的单分子的瞬时(600 μs)位移的高度统计,我们在这里量化了催化转换下四种高度竞争的酶的 D。因此,我们阐述了如何在 95% 的置信水平下实现 D 的精度优于 ±1%,并且在宽浓度范围的底物的应用下,过氧化氢酶、脲酶、醛缩酶和碱性磷酸酶的扩散率没有变化。因此,我们的单分子方法克服了最近研究所强调的潜在局限性和伪影,表明酶反应中的扩散没有增强。目录艺术品
Recent studies have sparked heated debate over whether catalytical reactions would enhance the diffusion coefficients D of enzymes. Through high statistics of the transient (600 μs) displacements of unhindered single molecules freely diffusing in common buffers, we here quantify D for four highly contested enzymes under catalytic turnovers. We thus formulate how precisions of better than ±1% may be achieved for D at the 95% confidence level, and show no changes in diffusivity for catalase, urease, aldolase, and alkaline phosphatase under the application of wide concentration ranges of substrates. Our single-molecule approach thus overcomes potential limitations and artifacts underscored by recent studies to show no enhanced diffusion in enzymatic reactions. Table of Contents artwork
DOI: 10.1039/c5fd00149h
发表时间: 2015
影响因子: 3.4
作者:
Moerner WE;Shechtman Y;Wang Q
通讯作者: Wang Q
DOI: 10.1101/645986
发表时间: 2019-05
期刊: bioRxiv
影响因子: --
作者:
Subhadip Ghosh;Farzad Mohajerani;S. Son;D. Velegol;P. Butler;Ayusman Sen
通讯作者: Subhadip Ghosh;Farzad Mohajerani;S. Son;D. Velegol;P. Butler;Ayusman Sen
DOI: 10.1021/ja908773a
发表时间: 2010-02-24
影响因子: 15
作者:
Muddana, Hari S.;Sengupta, Samudra;Mallouk, Thomas E.;Sen, Ayusman;Butler, Peter J.
通讯作者: Butler, Peter J.
DOI: --
发表时间: 2020
期刊: ArXivorg
影响因子: --
作者:
Xu, Mengqi;Rogers, W. Benjamin;Ahmed, Wylie W.;Ross, Jennifer L.
通讯作者: Ross, Jennifer L.