Harnessing naturally randomized transcription to infer regulatory relationships among genes.
Harnessing naturally randomized transcription to infer regulatory relationships among genes.
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DOI：
10.1186/gb-2007-8-10-r219
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发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Storey JD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chen LS;Emmert-Streib F;Storey JD
一种方法，利用随机化的基因型，严格推断基因之间的因果关系，在转录水平上的调控关系。该方法被应用到酵母的实验，产生新的见解的拓扑结构的酵母转录调控网络。我们开发了一种方法，利用随机化的基因型，严格推断基因之间的因果调控关系在转录水平上，基于实验中，基因分型和表达谱进行。这种方法可以用来建立转录调控网络，并确定假定的基因调控。我们将该方法应用于酵母实验，其中已知处于相同过程和功能的基因在由此产生的转录调控网络中被恢复。
An approach is developed that utilizes randomized genotypes to rigorously infer causal regulatory relationships among genes at the transcriptional level. The approach is applied to an experiment in yeast, yielding new insights into the topology of the yeast transcriptional regulatory network. We develop an approach utilizing randomized genotypes to rigorously infer causal regulatory relationships among genes at the transcriptional level, based on experiments in which genotyping and expression profiling are performed. This approach can be used to build transcriptional regulatory networks and to identify putative regulators of genes. We apply the method to an experiment in yeast, in which genes known to be in the same processes and functions are recovered in the resulting transcriptional regulatory network.
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