子宫内膜癌融合基因LINC02159-ATP10B的鉴定及表达研究
子宫内膜癌融合基因LINC02159-ATP10B的鉴定及表达研究
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DOI：
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发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
李小平
中科院分区：
文献类型：
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作者：
顾璇;刘锦锦;张焕芝;王琪;李小平
目的研究子宫内膜癌（EC）中融合基因LINC02159-ATP10B表达及其临床意义。方法（1）收集2020年12月至2022年12月北京大学人民医院妇科就诊，并经手术病理证实为子宫内膜癌患者组织32例，并收集正常子宫内膜组织15例及子宫内膜癌细胞系，采用RT-PCR结合Sanger测序扩增融合基因特异性融合片段进行融合基因LINC02159-ATP10B存在性鉴定；（2）利用ORFfinder预测融合基因蛋白产物并制备抗体；（3）通过RT-qPCR分子生物学结合CCLE数据库生物信息学分析方法，对EC样本中融合基因与母基因关系进行定量分析；（4）通过TCGA数据库生物信息学分析，研究融合基因与EC临床预后的相关性。结果（1）在EC组织和正常子宫内膜组织中融合基因LINC02159-ATP10B以融合转录本形式表达，其中EC中阳性率为37.5%，正常内膜中阳性率为13.3%，两组比较，差异无统计学意义（P=0.17），但在EC中阳性率更高趋势。（2）融合基.因LINC02159-ATP10B为编码框外融合，仅涉及5′UTR区的改变，蛋白产物为野生型ATP10B蛋白，大小约为130 kDa；（3）融合基因阳性组母基因LINC02159、ATP10B的表达高于阴性组，两组比较，差异有统计学意义（P均<0.001）；（4）ATP10B高表达组子宫内膜癌患者五年及十年的总生存期更短（P<0.05）。结论融合基因LINC02159-ATP10B在EC中表达高，可能与EC不良预后相关。