IICBU 2008: a proposed benchmark suite for biological image analysis.
IICBU 2008: a proposed benchmark suite for biological image analysis.
复制标题
IICBU 2008：提议的生物图像分析的基准套件。
DOI：
10.1007/s11517-008-0380-5
复制
发表时间：
2008-09
影响因子：
3.2
通讯作者：
Goldberg, Ilya G.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shamir, Lior;Orlov, Nikita;Eckley, David Mark;Macura, Tomasz J.;Goldberg, Ilya G.
自动生物图像采集的新技术引入了对有效生物图像分析方法的需求。这些算法由模式识别和机器视觉专家不断开发，他们根据生物成像的特定需求定制通用计算机视觉技术。然而，计算机科学家并不总是能够访问可用于计算机视觉研究的生物图像数据集，并且可以帮助定义生物学问题的生物学合作者并不总是可用的。在这里，我们提出了一个公开可用的生物图像数据集基准套件，机器视觉专家可以使用它来开发和评估生物图像分析方法。该套件代表了生物学中一系列实际的现实生活中的成像问题，并提供了细胞器、细胞和组织的例子，在不同的放大倍率和不同的对比技术下成像。所有数据集都可以在http://ome.grc.nia.nih.gov/iicbu2008上免费下载。
New technology for automated biological image acquisition has introduced the need for effective biological image analysis methods. These algorithms are constantly being developed by pattern recognition and machine vision experts, who tailor general computer vision techniques to the specific needs of biological imaging. However, computer scientists do not always have access to biological image datasets that can be used for computer vision research, and biologist collaborators who can assist in defining the biological questions are not always available. Here we propose a publicly available benchmark suite of biological image datasets that can be used by machine vision experts for developing and evaluating biological image analysis methods. The suite represents a set of practical real-life imaging problems in biology, and offers examples of organelles, cells and tissues, imaged at different magnifications and different contrast techniques. All datasets are available for free download at http://ome.grc.nia.nih.gov/iicbu2008.
登录
查看更多内容
影响因子：
5.8
作者：
Boland, MV;Murphy, RF
通讯作者：
Murphy, RF
影响因子：
3
作者：
Martone, ME;Zhang, SL;Ellisman, MH
通讯作者：
Ellisman, MH
影响因子：
5.1
作者：
Orlov, Nikita;Shamir, Lior;Goldberg, Ilya G.
通讯作者：
Goldberg, Ilya G.
开放显微镜环境（OME）数据模型和XML文件：开放工具用于生物成像中的信息学和定量分析。
影响因子：
12.3
作者：
Goldberg, IG;Allan, C;Burel, JM;Creager, D;Falconi, A;Hochheiser, H;Johnston, J;Mellen, J;Sorger, PK;Swedlow, JR
通讯作者：
Swedlow, JR