Germline DNA demethylation dynamics and imprint erasure through 5-hydroxymethylcytosine.
Germline DNA demethylation dynamics and imprint erasure through 5-hydroxymethylcytosine.
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DOI：
10.1126/science.1229277
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发表时间：
2013-01-25
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Surani MA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hackett JA;Sengupta R;Zylicz JJ;Murakami K;Lee C;Down TA;Surani MA
小鼠原始生殖细胞（PGC）经历连续的表观遗传变化和全基因组DNA去甲基化以重置表观基因组以实现全能性。在这里，我们证明了PGCs中CpG甲基化（5 mC）的消除通过转化为5-羟甲基胞嘧啶（5 hmC）发生，由高水平的TET 1和TET 2驱动。在胚胎第9.5-E10.5天，PGCs中向5 hmC的整体转换异步启动，并解释了印记擦除的独特过程。从机制上讲，5 hmC富集之后是其以与复制偶联稀释一致的速率持续下降。转换为5 hmC是并行冗余系统的重要组成部分，可驱动PGC中的全面重新编程。尽管如此，我们确定了罕见的调控元件，逃避系统的DNA去甲基化在PGCs，提供了一个潜在的机制基础，跨代表观遗传。
Mouse primordial germ cells (PGC) undergo sequential epigenetic changes and genome-wide DNA demethylation to reset the epigenome for totipotency. Here, we demonstrate that erasure of CpG methylation (5mC) in PGCs occurs via conversion to 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), driven by high levels of TET1 and TET2. Global conversion to 5hmC initiates asynchronously among PGCs at embryonic day (E) 9.5-E10.5 and accounts for the unique process of imprint erasure. Mechanistically, 5hmC enrichment is followed by its protracted decline thereafter at a rate consistent with replication-coupled dilution. The conversion to 5hmC is a significant component of parallel redundant systems that drive comprehensive reprogramming in PGCs. Nonetheless, we identify rare regulatory elements that escape systematic DNA demethylation in PGCs, providing a potential mechanistic basis for transgenerational epigenetic inheritance.
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影响因子：
64.8
作者：
Hajkova, Petra;Ancelin, Katia;Waldmann, Tanja;Lacoste, Nicolas;Lange, Ulrike C.;Cesari, Francesca;Lee, Caroline;Almouzni, Genevieve;Schneider, Robert;Surani, M. Azim
通讯作者：
Surani, M. Azim
影响因子：
23.9
作者：
Dawlaty, Meelad M.;Ganz, Kibibi;Powell, Benjamin E.;Hu, Yueh-Chiang;Markoulaki, Styliani;Cheng, Albert W.;Gao, Qing;Kim, Jongpil;Choi, Sang-Woon;Page, David C.;Jaenisch, Rudolf
通讯作者：
Jaenisch, Rudolf
影响因子：
30.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
DOI：
10.1126/science.1170116
发表时间：
2009-05-15
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Tahiliani M;Koh KP;Shen Y;Pastor WA;Bandukwala H;Brudno Y;Agarwal S;Iyer LM;Liu DR;Aravind L;Rao A
通讯作者：
Rao A