Extended Stokes shift in fluorescent proteins: chromophore-protein interactions in a near-infrared TagRFP675 variant.
Extended Stokes shift in fluorescent proteins: chromophore-protein interactions in a near-infrared TagRFP675 variant.
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DOI：
10.1038/srep01847
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发表时间：
2013
影响因子：
4.6
通讯作者：
Verkhusha, Vladislav V.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Piatkevich, Kiryl D.;Malashkevich, Vladimir N.;Morozova, Kateryna S.;Nemkovich, Nicolai A.;Almo, Steven C.;Verkhusha, Vladislav V.
大多数gfp样荧光蛋白表现出小的斯托克斯位移（10-45 nm），这是由于发色团环境的刚性，不包括非荧光弛化到基态。红色荧光蛋白mKate的一个不寻常的近红外衍生物，命名为TagRFP675，表现出斯托克斯位移，与亲本蛋白相比延伸了30 nm。生理条件下，TagRFP675在598 nm处吸收，在675 nm处发射，是gfp样蛋白家族中红移最多的蛋白。此外，其发射最大值强烈依赖于激发波长。TagRFP675的结构揭示了常见的dsred样发色团，然而，它通过具有大灵活性的广泛氢键网络与蛋白质基质相互作用。基于光谱、生化和结构分析，我们认为发色团和蛋白质基质之间氢键相互作用的重排是导致TagRFP675光谱特性的原因。
Most GFP-like fluorescent proteins exhibit small Stokes shifts (10–45 nm) due to rigidity of the chromophore environment that excludes non-fluorescent relaxation to a ground state. An unusual near-infrared derivative of the red fluorescent protein mKate, named TagRFP675, exhibits the Stokes shift, which is 30 nm extended comparing to that of the parental protein. In physiological conditions, TagRFP675 absorbs at 598 nm and emits at 675 nm that makes it the most red-shifted protein of the GFP-like protein family. In addition, its emission maximum strongly depends on the excitation wavelength. Structures of TagRFP675 revealed the common DsRed-like chromophore, which, however, interacts with the protein matrix via an extensive network of hydrogen bonds capable of large flexibility. Based on the spectroscopic, biochemical, and structural analysis we suggest that the rearrangement of the hydrogen bond interactions between the chromophore and the protein matrix is responsible for the TagRFP675 spectral properties.
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DOI：
10.1073/pnas.1013910107
发表时间：
2010-11-23
影响因子：
11.1
作者：
Chica, Roberto A.;Moore, Matthew M.;Mayo, Stephen L.
通讯作者：
Mayo, Stephen L.
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
3.4
作者：
Morozova, Kateryna S.;Piatkevich, Kiryl D.;Verkhusha, Vladislav V.
通讯作者：
Verkhusha, Vladislav V.
DOI：
10.1107/s0907444912020598
发表时间：
2012-09-01
期刊：
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY
影响因子：
--
作者：
Pletnev, Sergei;Pletneva, Nadya V.;Pletnev, Vladimir
通讯作者：
Pletnev, Vladimir
影响因子：
--
作者：
Lin MZ;McKeown MR;Ng HL;Aguilera TA;Shaner NC;Campbell RE;Adams SR;Gross LA;Ma W;Alber T;Tsien RY
通讯作者：
Tsien RY