Gene expression data preprocessing
Gene expression data preprocessing
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btg040
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发表时间：
2003-03-22
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Dopazo, J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Herrero, J;Díaz-Uriarte, R;Dopazo, J
我们提出了一个交互式的网络工具预处理微阵列基因表达数据。它分析数据，建议最适当的转换，并在用户同意后继续进行。正常的预处理步骤包括尺度转换、缺失值管理、重复处理、平面模式过滤和模式标准化，并且它们在执行任何模式分析之前都是必需的。处理后的数据集可以发送到其他模式分析工具。
We present an interactive web tool for preprocessing microarray gene expression data. It analyses the data, suggests the most appropriate transformations and proceeds with them after user agreement. The normal preprocessing steps include scale transformations, management of missing values, replicate handling, flat pattern filtering and pattern standardization and they are required before performing any pattern analysis. The processed data set can be sent to other pattern analysis tools.