Bacterial CRISPR screens for gene function.

Bacterial CRISPR screens for gene function.
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用于基因功能的细菌CRISPR筛选

DOI:
10.1016/j.mib.2020.11.005
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发表时间:
2021-03
影响因子:
5.4
通讯作者:
Gross CA
Gross CA
中科院分区:
生物学2区
文献类型:
--
作者:
Todor H;Silvis MR;Osadnik H;Gross CA

文献摘要

参考文献

被引文献

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在这篇综述中,我们描述了CRISPR工具在细菌功能基因组学筛选中的应用,重点关注干扰(CRISPRi)方法的使用。我们回顾了CRISPRi滴定的最新进展,它使必需基因功能筛选和全基因组规模的混合CRISPRi筛选成为可能。我们总结了在非模式细菌和致病细菌中实现CRISPRi筛选的进展,包括新的dCas9变体的开发。考虑到该领域的现状,我们对用于确定细菌基因功能的CRISPRi策略进行了前瞻性分析。
In this review we describe the application of CRISPR tools for functional genomics screens in bacteria, with a focus on the use of interference (CRISPRi) approaches. We review recent developments in CRISPRi titration, which has enabled essential gene functional screens, and genome-scale pooled CRISPRi screens. We summarize progress toward enabling CRISPRi screens in non-model and pathogenic bacteria, including the development of new dCas9 variants. Taking into account the current state of the field, we provide a forward-looking analysis of CRISPRi strategies for determining gene function in bacteria.
DOI: 10.1038/s41467-018-04901-6
发表时间: 2018-06-27
影响因子: 16.6
作者:
Dong C;Fontana J;Patel A;Carothers JM;Zalatan JG
通讯作者: Zalatan JG
用于诱导双蛋白表达的单质粒系统和乳酸菌乳酸菌中的CRISPR-CAS9/CRISPR-CAS9/CRISPRI基因调节。
DOI: 10.1038/s41598-018-19402-1
发表时间: 2018-01-17
期刊: Scientific reports
影响因子: 4.6
作者:
Berlec A;Škrlec K;Kocjan J;Olenic M;Štrukelj B
通讯作者: Štrukelj B
DOI: 10.1038/s41564-019-0423-8
发表时间: 2019-07-01
影响因子: 28.3
作者:
Lee, Henry H.;Ostrov, Nili;Church, George M.
通讯作者: Church, George M.
DOI: 10.1126/science.1225829
发表时间: 2012-08-17
期刊: SCIENCE
影响因子: 56.9
作者:
Jinek, Martin;Chylinski, Krzysztof;Charpentier, Emmanuelle
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发表时间: 2018-09-01
影响因子: 4.7
作者:
Fontana, Jason;Dong, Chen;Carothers, James M.
通讯作者: Carothers, James M.