A knowledge-guided kidney cell census-reconciling bulk omics with cellular heterogeneity?
A knowledge-guided kidney cell census-reconciling bulk omics with cellular heterogeneity?
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以知识为指导的肾细胞普查，使大量组学与细胞异质性相协调？
DOI：
10.1016/j.kint.2018.12.016
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发表时间：
2019
影响因子：
19.6
通讯作者：
Müller
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rinschen;Müller
Clarket等人提供了一项基于知识的精心策划的43种已知典型肾脏细胞类型的普查，其基础是计算出的对总肾脏质量的贡献和分子标记的表达。他们的研究阐明了批量转录组学的局限性，但也为他们富有成效的解释提供了指导。根据他们的发现，批量测序数据集与单细胞转录组学相结合的使用可能有助于在肾脏研究中开发综合组学分析。
Clarket al.present a curated knowledge-based census of 43 known canonical kidney cell types, based on calculated contribution to total kidney mass and expression of molecular markers. Their study illustrates limitations of bulk transcriptomics but also provides guidance to their fruitful interpretation. In the light of their findings, the use of bulk sequencing datasets in conjunction with single-cell transcriptomics could contribute to the exploitation of integrative omics analyses in kidney research.
影响因子：
19.6
作者：
Spaeth, Martin R.;Bartram, Malte P.;Rinschen, Markus M.
通讯作者：
Rinschen, Markus M.
影响因子：
23.9
作者：
Kramann, Rafael;Schneider, Rebekka K.;DiRocco, Derek P.;Machado, Flavia;Fleig, Susanne;Bondzie, Philip A.;Henderson, Joel M.;Ebert, Benjamin L.;Humphreys, Benjamin D.
通讯作者：
Humphreys, Benjamin D.