基于线粒体ND2基因序列的少鳞(鱚)遗传多样性研究
基于线粒体ND2基因序列的少鳞(鱚)遗传多样性研究
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DOI：
10.12131/20190042
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发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
斯舒谨
中科院分区：
文献类型：
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作者：
郑德育;郭易佳;杨天燕;高天翔;郑瑶;袁冬皓;斯舒谨
以莱州、胶南、舟山、厦门、汕头和北海6个群体119尾少鳞(鱚)(Sillago japonica)为研究对象,采用PCR扩增测序获得长度为450 bp的线粒体DNA NADH脱氢酶亚基2(ND2)基因片段,共检测到77个变异位点,其中简约信息位点30个,单变异位点28个,无碱基缺失。119条序列定义了61个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.945 3±0.015 5和0.009 718±0.005 445。6个群体间的平均遗传距离为0.008 3,遗传分化指数FST均小于0.05,各群体间无显著遗传分化。AMOVA分析得出少鳞(鱚)的遗传变异主要来自于种群内个体间(99.96%)。中性检验的Tajima's D和Fu's Fs统计值均为负值且显著偏离中性,核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布,表明少鳞(鱚)历史上经历了群体扩张事件,估算扩张时间大约在(0.12~0.29)百万年前的第四纪更新世晚期。