PESTO: Parameter EStimation TOolbox.

PESTO: Parameter EStimation TOolbox.
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DOI:
10.1093/bioinformatics/btx676
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发表时间:
2018-02-15
期刊:
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子:
--
通讯作者:
Hasenauer J
Hasenauer J
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
Stapor P;Weindl D;Ballnus B;Hug S;Loos C;Fiedler A;Krause S;Hroß S;Fröhlich F;Hasenauer J

文献摘要

参考文献

被引文献

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PESTO是MathWorks MATLAB中广泛适用且高度可定制的参数估计工具箱。它为优化、不确定性和可识别性分析提供了可扩展的算法,这些算法以非常通用的方式工作,将目标函数视为黑盒。因此,PESTO可以用于任何参数估计问题,用户可以在MATLAB中提供确定性的目标函数。PESTO是一个MATLAB工具箱,在BSD许可下免费提供。源代码以及大量文档和示例代码可以从https://github.com/ICB-DCM/PESTO/下载。补充数据可在生物信息学网站获得。
PESTO is a widely applicable and highly customizable toolbox for parameter estimation in MathWorks MATLAB. It offers scalable algorithms for optimization, uncertainty and identifiability analysis, which work in a very generic manner, treating the objective function as a black box. Hence, PESTO can be used for any parameter estimation problem, for which the user can provide a deterministic objective function in MATLAB. PESTO is a MATLAB toolbox, freely available under the BSD license. The source code, along with extensive documentation and example code, can be downloaded from https://github.com/ICB-DCM/PESTO/. Supplementary data are available at Bioinformatics online.
DOI: 10.1145/1089014.1089020
发表时间: 2005-09-01
影响因子: 2.7
作者:
Hindmarsh, AC;Brown, PN;Woodward, CS
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DOI: 10.1016/j.csda.2011.11.020
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Boiger, R.;Hasenauer, J.;Kaltenbacher, B.
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