Merging NMR Data and Computation Facilitates Data-Centered Research.
Merging NMR Data and Computation Facilitates Data-Centered Research.
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DOI：
10.3389/fmolb.2021.817175
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发表时间：
2021
影响因子：
5
通讯作者：
Wilburn CW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Baskaran K;Craft DL;Eghbalnia HR;Gryk MR;Hoch JC;Maciejewski MW;Schuyler AD;Wedell JR;Wilburn CW
生物磁共振数据库（Biological Magnetic Resonance Data Bank， BMRB）服务于核磁共振结构生物学学界已有40年的历史，并在许多广泛使用的工具的开发中发挥了重要作用。它通过体现FAIR数据原则（可查找、可访问、可互操作和可重用）来促进结构生物学中数据资源的重用。NMRbox的历史还不到十年，但它通过提供NMR软件和高性能计算资源来补充BMRB，促进了软件资源的重用。BMRB和NMRbox都有助于可重复性研究。NMRbox还促进了复杂元软件的开发和部署。结合BMRB和NMRbox有助于加快和简化利用BMRB的工作流程，并使BMRB与其他数据存储库的联合变得容易。BMRB和NMRbox的结合使用将带来更多的进步，如机器学习，这将变得越来越强大。
The Biological Magnetic Resonance Data Bank (BMRB) has served the NMR structural biology community for 40 years, and has been instrumental in the development of many widely-used tools. It fosters the reuse of data resources in structural biology by embodying the FAIR data principles (Findable, Accessible, Inter-operable, and Re-usable). NMRbox is less than a decade old, but complements BMRB by providing NMR software and high-performance computing resources, facilitating the reuse of software resources. BMRB and NMRbox both facilitate reproducible research. NMRbox also fosters the development and deployment of complex meta-software. Combining BMRB and NMRbox helps speed and simplify workflows that utilize BMRB, and enables facile federation of BMRB with other data repositories. Utilization of BMRB and NMRbox in tandem will enable additional advances, such as machine learning, that are poised to become increasingly powerful.
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DOI：
10.1016/j.str.2017.10.009
发表时间：
2017-12-05
期刊：
Structure (London, England : 1993)
影响因子：
--
作者：
Gore S;Sanz García E;Hendrickx PMS;Gutmanas A;Westbrook JD;Yang H;Feng Z;Baskaran K;Berrisford JM;Hudson BP;Ikegawa Y;Kobayashi N;Lawson CL;Mading S;Mak L;Mukhopadhyay A;Oldfield TJ;Patwardhan A;Peisach E;Sahni G;Sekharan MR;Sen S;Shao C;Smart OS;Ulrich EL;Yamashita R;Quesada M;Young JY;Nakamura H;Markley JL;Berman HM;Burley SK;Velankar S;Kleywegt GJ
通讯作者：
Kleywegt GJ
影响因子：
64.8
作者：
Jumper J;Evans R;Pritzel A;Green T;Figurnov M;Ronneberger O;Tunyasuvunakool K;Bates R;Žídek A;Potapenko A;Bridgland A;Meyer C;Kohl SAA;Ballard AJ;Cowie A;Romera-Paredes B;Nikolov S;Jain R;Adler J;Back T;Petersen S;Reiman D;Clancy E;Zielinski M;Steinegger M;Pacholska M;Berghammer T;Bodenstein S;Silver D;Vinyals O;Senior AW;Kavukcuoglu K;Kohli P;Hassabis D
通讯作者：
Hassabis D
影响因子：
14.9
作者：
wwPDB consortium
通讯作者：
wwPDB consortium
DOI：
10.1007/978-1-4939-7000-1_26
发表时间：
2017
期刊：
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
影响因子：
--
作者：
Burley SK;Berman HM;Kleywegt GJ;Markley JL;Nakamura H;Velankar S
通讯作者：
Velankar S
DOI：
10.1046/j.1432-1327.1998.2560001.x
发表时间：
1998-08-01
期刊：
EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子：
--
作者：
Markley, JL;Bax, A;Wüthrich, K
通讯作者：
Wüthrich, K