MOSAIC - A Unified Trait Database to Complement Structured Population Models.
MOSAIC - A Unified Trait Database to Complement Structured Population Models.
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DOI：
10.1038/s41597-023-02070-w
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发表时间：
2023-06-01
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Salguero-Gomez, Roberto
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bernard, Connor;Santos, Gabriel Silva;Deere, Jacques A.;Rodriguez-Caro, Roberto;Capdevila, Pol;Kusch, Erik;Gascoigne, Samuel J. L.;Jackson, John;Salguero-Gomez, Roberto
尽管生态数据的可获得性呈指数级增长，但需要数据集之间更广泛的互操作性来释放开放获取的潜力。我们对人口学和功能特征的接口的理解处于有利地位，可以从这种互操作性中受益。在这里，我们介绍MOSAIC，这是一个开放访问的特征数据库，可以解锁存储在Comadre、Compadre和Padrino开放访问数据库中的人口潜力。马赛克数据通过现有数据集和来自原始文献的新特征记录的组合被数字化和精选。在其第一个版本中，MOSAIC(版本1.0.0)包括300个动植物物种的14个特征域：生物量、高度、生长决定、再生、两性、交配系统、两性、顺序两性、扩散能力、扩散类型、扩散模式、扩散类别、种群和水生生境依赖。马赛克包括1,359个物种的物种级系统发育图和特定于种群的气候数据。我们确定数据库集成如何提高我们对现有存储库中量化良好的特征和量化较差的特征(例如，增长决定、模块化)的理解。MOSAIC强调了与标准化数据库和人口统计措施相关的新挑战。
Despite exponential growth in ecological data availability, broader interoperability amongst datasets is needed to unlock the potential of open access. Our understanding of the interface of demography and functional traits is well-positioned to benefit from such interoperability. Here, we introduce MOSAIC, an open-access trait database that unlocks the demographic potential stored in the COMADRE, COMPADRE, and PADRINO open-access databases. MOSAIC data were digitised and curated through a combination of existing datasets and new trait records sourced from primary literature. In its first release, MOSAIC (v. 1.0.0) includes 14 trait fields for 300 animal and plant species: biomass, height, growth determination, regeneration, sexual dimorphism, mating system, hermaphrodism, sequential hermaphrodism, dispersal capacity, type of dispersal, mode of dispersal, dispersal classes, volancy, and aquatic habitat dependency. MOSAIC includes species-level phylogenies for 1,359 species and population-specific climate data. We identify how database integration can improve our understanding of traits well-quantified in existing repositories and those that are poorly quantified (e.g., growth determination, modularity). MOSAIC highlights emerging challenges associated with standardising databases and demographic measures.
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影响因子：
9.8
作者：
Ashman, Tia-Lynn;Bachtrog, Doris;Blackmon, Heath;Goldherg, Emma E.;Hahn, Matthew W.;Kirkpatrick, Mark;Kitano, Jun;Mank, Judith E.;Mayrose, Itay;Ming, Ray;Otto, Sarah P.;Peichel, Catherine L.;Pennell, Matthew W.;Perrin, Nicolas;Ross, Laura;Valenzuela, Nicole;Vamosi, Jana C.
通讯作者：
Vamosi, Jana C.
DOI：
10.1073/pnas.1315179111
发表时间：
2014-01-14
影响因子：
11.1
作者：
Adler, Peter B.;Salguero-Gomez, Roberto;Franco, Miguel
通讯作者：
Franco, Miguel
影响因子：
5.5
作者：
Carmona, Carlos P.;de Bello, Francesco;Peco, Begona
通讯作者：
Peco, Begona
影响因子：
6.7
作者：
Davy, Richard;Kusch, Erik
通讯作者：
Kusch, Erik
影响因子：
64.8
作者：
Diaz, Sandra;Kattge, Jens;Gorne, Lucas D.
通讯作者：
Gorne, Lucas D.