Exome sequencing identifies mutation in CNOT3 and ribosomal genes RPL5 and RPL10 in T-cell acute lymphoblastic leukemia.
Exome sequencing identifies mutation in CNOT3 and ribosomal genes RPL5 and RPL10 in T-cell acute lymphoblastic leukemia.
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DOI：
10.1038/ng.2508
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发表时间：
2013-03
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Cools J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
De Keersmaecker K;Atak ZK;Li N;Vicente C;Patchett S;Girardi T;Gianfelici V;Geerdens E;Clappier E;Porcu M;Lahortiga I;Lucà R;Yan J;Hulselmans G;Vranckx H;Vandepoel R;Sweron B;Jacobs K;Mentens N;Wlodarska I;Cauwelier B;Cloos J;Soulier J;Uyttebroeck A;Bagni C;Hassan BA;Vandenberghe P;Johnson AW;Aerts S;Cools J
t细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）是由多种致瘤病变共同引起的。我们对67个t - all进行了外显子组测序，以深入了解这些白血病的突变谱。我们在508个基因中检测到蛋白改变突变，在儿童中平均有8.2个突变，在成人T-ALL中平均有21.0个突变。通过严格的筛选，我们预测了T-ALL中七个新的致癌驱动基因。我们在89个成年t - all中鉴定出7个（7.9%）的CNOT3是肿瘤抑制因子突变，在致敏的黑腹果蝇模型中，CNOT3的敲除导致肿瘤。此外，我们在122例儿童t - all中鉴定了12例（9.8%）影响核糖体蛋白RPL5和RPL10的突变，RPL10中Arg98的复发性改变。表达RPL10 Arg98Ser突变体的酵母和淋巴样细胞表现出核糖体生物发生缺陷。我们的数据提供了对儿童和成人T-ALL突变景观的见解，并确定核糖体是一个潜在的致癌因素。
T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is caused by the cooperation of multiple oncogenic lesions. We used exome sequencing on 67 T-ALLs to gain insight into the mutational spectrum in these leukemias. We detected protein-altering mutations in 508 genes, with an average of 8.2 mutations in pediatric and 21.0 mutations in adult T-ALL. Using stringent filtering, we predict seven new oncogenic driver genes in T-ALL. We identify CNOT3 as a tumor suppressor mutated in 7 of 89 (7.9%) adult T-ALLs, and its knockdown causes tumors in a sensitized Drosophila melanogaster model. In addition, we identify mutations affecting the ribosomal proteins RPL5 and RPL10 in 12 of 122 (9.8%) pediatric T-ALLs, with recurrent alterations of Arg98 in RPL10. Yeast and lymphoid cells expressing the RPL10 Arg98Ser mutant showed a ribosome biogenesis defect. Our data provide insights into the mutational landscape of pediatric versus adult T-ALL and identify the ribosome as a potential oncogenic factor.
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影响因子：
82.9
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
9.8
作者：
Lederer, Damien;Grisart, Bernard;Verellen-Dumoulin, Christine
通讯作者：
Verellen-Dumoulin, Christine
DOI：
10.1084/jem.20110921
发表时间：
2011-07-04
期刊：
The Journal of experimental medicine
影响因子：
--
作者：
Fabbri G;Rasi S;Rossi D;Trifonov V;Khiabanian H;Ma J;Grunn A;Fangazio M;Capello D;Monti S;Cresta S;Gargiulo E;Forconi F;Guarini A;Arcaini L;Paulli M;Laurenti L;Larocca LM;Marasca R;Gattei V;Oscier D;Bertoni F;Mullighan CG;Foá R;Pasqualucci L;Rabadan R;Dalla-Favera R;Gaidano G
通讯作者：
Gaidano G
影响因子：
7
作者：
Dees ND;Zhang Q;Kandoth C;Wendl MC;Schierding W;Koboldt DC;Mooney TB;Callaway MB;Dooling D;Mardis ER;Wilson RK;Ding L
通讯作者：
Ding L
影响因子：
10.5
作者：
Hu, Guang;Kim, Jonghwan;Elledge, Stephen J.
通讯作者：
Elledge, Stephen J.