糖尿病足溃疡相关基因与免疫细胞特征分析
糖尿病足溃疡相关基因与免疫细胞特征分析
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DOI：
10.3969/j.issn.1674-8115.2020.10.009
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
张文川
中科院分区：
文献类型：
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作者：
周晗;杨晓笙;廖陈龙;张文川
目的·探究糖尿病足溃疡(diabetic foot ulceration,DFU)相关基因的表达以及免疫细胞的特征。方法·从GEO数据库下载基因表达数据集GSE80178,利用其中6个DFU样本及3个糖尿病足皮肤(diabetic foot skin,DFS)样本,鉴别DFU与DFS的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),以基因本体论(Gene Ontology,GO)注释DEG可能涉及的生物过程及细胞成分,并利用反卷积方法计算并比较DFU、DFS及非糖尿病足部皮肤(non-diabetic foot skin,nDFS)的免疫细胞相对比例差异。结果·共获得296个DFU与DFS的DEG,包括80个上调基因和216个下调基因。GO分析发现,DEG在细胞成分上主要富集于细胞外泌体和细胞外空间;在生物过程中,DEG富集于角质形成细胞分化、角质化、中性粒细胞趋化等。DFS与nDFS比较,未发现免疫细胞比例差异;而DFU与DFS比较,DFU中活化肥大细胞、静息自然杀伤细胞、CD8+ T细胞、单核细胞比例增加。结论· DFU发病过程中,病灶局部可能存在主动角化与免疫调节过程,活化肥大细胞、静息自然杀伤细胞、CD8+ T细胞、单核细胞可能在病灶浸润增加;高血糖本身可能对皮肤局部的免疫细胞相对数量影响较小。