The Brain Observatory Storage Service and Database (BossDB): A Cloud-Native Approach for Petascale Neuroscience Discovery.
The Brain Observatory Storage Service and Database (BossDB): A Cloud-Native Approach for Petascale Neuroscience Discovery.
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DOI：
10.3389/fninf.2022.828787
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发表时间：
2022
影响因子：
3.5
通讯作者：
Wester B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hider R Jr;Kleissas D;Gion T;Xenes D;Matelsky J;Pryor D;Rodriguez L;Johnson EC;Gray-Roncal W;Wester B
成像和数据获取方面的技术进步导致了PB级神经科学图像数据集的发展。这些大规模的体积数据集构成了独特的挑战，因为分析往往跨越整个体积，需要一个统一的平台才能访问它。在本文中，我们描述了大脑观测存储服务和数据库(BossDB)，这是一个基于云的存储和访问PB级图像数据集的解决方案。BossDB通过REST风格的应用程序编程接口(API)提供对数据获取、存储、可视化和共享的支持。一个关键功能是空间数据的可伸缩索引以及自动和手动注释，以促进数据发现。我们的项目是开源的，可以轻松且经济高效地用于各种医疗设备和应用程序，并且已经有效地处理了超过1PB大小的数据集。
Technological advances in imaging and data acquisition are leading to the development of petabyte-scale neuroscience image datasets. These large-scale volumetric datasets pose unique challenges since analyses often span the entire volume, requiring a unified platform to access it. In this paper, we describe the Brain Observatory Storage Service and Database (BossDB), a cloud-based solution for storing and accessing petascale image datasets. BossDB provides support for data ingest, storage, visualization, and sharing through a RESTful Application Programming Interface (API). A key feature is the scalable indexing of spatial data and automatic and manual annotations to facilitate data discovery. Our project is open source and can be easily and cost effectively used for a variety of modalities and applications, and has effectively worked with datasets over a petabyte in size.
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影响因子：
64.8
作者：
Bock, Davi D.;Lee, Wei-Chung Allen;Kerlin, Aaron M.;Andermann, Mark L.;Hood, Greg;Wetzel, Arthur W.;Yurgenson, Sergey;Soucy, Edward R.;Kim, Hyon Suk;Reid, R. Clay
通讯作者：
Reid, R. Clay
影响因子：
8.8
作者：
Wilson, Alyssa Michelle;Schalek, Richard;Lichtman, Jeff William
通讯作者：
Lichtman, Jeff William
影响因子：
--
作者：
Matelsky, Jordan K;Downs, Joseph;Gray-Roncal, William
通讯作者：
Gray-Roncal, William
影响因子：
64.5
作者：
Phelps JS;Hildebrand DGC;Graham BJ;Kuan AT;Thomas LA;Nguyen TM;Buhmann J;Azevedo AW;Sustar A;Agrawal S;Liu M;Shanny BL;Funke J;Tuthill JC;Lee WA
通讯作者：
Lee WA
DOI：
10.1145/2484838.2484870
发表时间：
2013
期刊：
Scientific and statistical database management : International Conference, SSDBM ... : proceedings. International Conference on Scientific and Statistical Database Management
影响因子：
--
作者：
Burns R;Roncal WG;Kleissas D;Lillaney K;Manavalan P;Perlman E;Berger DR;Bock DD;Chung K;Grosenick L;Kasthuri N;Weiler NC;Deisseroth K;Kazhdan M;Lichtman J;Reid RC;Smith SJ;Szalay AS;Vogelstein JT;Vogelstein RJ
通讯作者：
Vogelstein RJ