Genome-wide distribution of linker histone H1.0 is independent of MeCP2.
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DOI：
10.1038/s41593-018-0155-8
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发表时间：
2018-06
影响因子：
25
通讯作者：
Zoghbi HY
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ito-Ishida A;Yamalanchili HK;Shao Y;Baker SA;Heckman LD;Lavery LA;Kim JY;Lombardi LM;Sun Y;Liu Z;Zoghbi HY
以前的研究表明，MeCP 2与连接组蛋白H1竞争，但这一假设从未在体内进行过测试。在这里，我们在小鼠前脑兴奋性神经元中进行Flag-taged-H1.0的ChIP-Seq。出乎意料的是，Flag-H1.0和MeCP 2占据相似的基因组区域，并且在MeCP 2耗尽后Flag-H1.0结合没有改变。此外，H1.0的轻度过表达没有改变MeCP 2结合，表明MeCP 2和H1.0的功能结合在很大程度上是独立的。
Previous studies suggested that MeCP2 competes with linker histone H1, but this hypothesis has never been tested in vivo. Here, we performed ChIP-Seq of Flag-tagged-H1.0 in mouse forebrain excitatory neurons. Unexpectedly, Flag-H1.0 and MeCP2 occupied similar genomic regions and the Flag-H1.0 binding was not changed upon MeCP2 depletion. Furthermore, mild overexpression of H1.0 did not alter MeCP2 binding, suggesting that the functional binding of MeCP2 and H1.0 are largely independent.
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影响因子：
5.3
作者：
Sugino, Ken;Hempel, Chris M.;Nelson, Sacha B.
通讯作者：
Nelson, Sacha B.
DOI：
10.1093/bioinformatics/btq033
发表时间：
2010-03-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Quinlan AR;Hall IM
通讯作者：
Hall IM
影响因子：
16
作者：
Skene, Peter J.;Illingworth, Robert S.;Webb, Shaun;Kerr, Alastair R. W.;James, Keith D.;Turner, Daniel J.;Andrews, Rob;Bird, Adrian P.
通讯作者：
Bird, Adrian P.
DOI：
10.1126/science.1234654
发表时间：
2013-04-05
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Lu X;Wontakal SN;Kavi H;Kim BJ;Guzzardo PM;Emelyanov AV;Xu N;Hannon GJ;Zavadil J;Fyodorov DV;Skoultchi AI
通讯作者：
Skoultchi AI
DOI：
10.1073/pnas.1505909112
发表时间：
2015-04-28
影响因子：
11.1
作者：
Chen, Lin;Chen, Kaifu;Zoghbi, Huda Y.
通讯作者：
Zoghbi, Huda Y.