湖北省黄冈地区啮齿动物携带汉坦病毒M片段基因特征分析
湖北省黄冈地区啮齿动物携带汉坦病毒M片段基因特征分析
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DOI：
10.3969/j.issn.2095-6894.2017.04.013
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
杨占秋
中科院分区：
文献类型：
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作者：
刘冰玉;倪向荣;冉从盾;唐辉;陈禹铭;刘东瀛;杨占秋
目的:探讨湖北省黄冈地区野生啮齿动物自然感染汉坦病毒(hantavirus)情况及病毒基因分型特征.方法:2012~2013年秋冬季在湖北省黄冈地区的野外及居民区采用夹夜法捕鼠.对捕获的动物进行分类鉴定,取其肺脏提取RNA,合成Seoul病毒(SEOV)和汉滩病毒(HTNV)特异性引物,以RT-PCR方法扩增部分M片段核苷酸序列,对PCR产物进行测序,并进行系统发育和序列同源性分析.结果:共捕获啮齿类动物95只,其中褐家鼠75只(78.94%).6份(8.00%)褐家鼠标本SEOV阳性.系统发育分析关系显示当地SEOV属于A组,与Z37株同源性为95.80%~96.30%(核苷酸),97.90%~100%(氨基酸).黄胸鼠和黑线姬鼠SEOV和HTNV均为阴性.结论:湖北省黄冈地区的优势鼠种是褐家鼠,汉坦病毒型别主要是SEOV,其系统发育关系属于A组,且与疫苗株Z37同源性最高.该研究结果有助于为黄冈地区HFRS的预防提供理论依据.