Using the Generic Genome Browser (GBrowse).
Using the Generic Genome Browser (GBrowse).
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DOI：
10.1002/0471250953.bi0909s28
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发表时间：
2009-12-01
影响因子：
--
通讯作者：
Donlin, Maureen J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Donlin, Maureen J
基因组浏览器是一种软件，它允许用户在参考序列（如染色体或重叠群）的背景下可视化DNA、蛋白质或其他序列特征。通用基因组浏览器（GBrowse）是作为通用模式生物数据库项目（Stein等人，2002年）的一部分开发的一种开源浏览器。GBrowse可被配置为显示任何生物的基因组序列特征，并且是用于模式生物黑腹果蝇（Grumbling和Strelets，2006年）和秀丽隐杆线虫（Schwarz等人，2006年）等的浏览器。该软件包可从网上下载，并可在Windows、Mac OS X或类Unix系统上运行。如原始方案中所述，1.64版本于2005年11月发布，但该软件正在积极开发中，大约每六个月发布一次新版本。本次更新包括有关使用来自美国国家生物技术信息中心（NCBI）的新文件更新现有数据源的说明。
A genome browser is software that allows users to visualize DNA, protein, or other sequence features within the context of a reference sequence, such as a chromosome or contig. The Generic Genome Browser (GBrowse) is an open-source browser developed as part of the Generic Model Organism Database project (Stein et al., 2002). GBrowse can be configured to display genomic sequence features for any organism and is the browser used for the model organisms Drosophila melanogaster (Grumbling and Strelets, 2006) and Caenorhabditis elegans (Schwarz et al., 2006), among others. The software package can be downloaded from the Web and run on a Windows, Mac OS X, or Unix-type system. Version 1.64, as described in the original protocol, was released in November 2005, but the software is under active development and new versions are released about every six months. This update includes instructions on updating existing data sources with new files from NCBI.