基于高通量测序的青叶胆转录组研究

基于高通量测序的青叶胆转录组研究
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DOI:
10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2018.03.012
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发表时间:
2018
期刊:
中国现代应用药学
影响因子:
--
通讯作者:
刘小莉
刘小莉
中科院分区:
其他
文献类型:
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作者:
吴昕怡;严媛;刘小莉

文献摘要

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:目的 探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础。方法 采用 Illumina Hiseq 2500 高通量测序技术,对青叶.胆全草进行转录组测序。结果 共获得 68 643 个 unigene,平均长度 901 bp,共有 42 954 条 unigene 注释到 NR,SwissProt,.COG,KOG,GO,Pfam 数据库中,獐牙菜苦苷生物合成的 3 个阶段中,有 43 条 unigene 参与中间体的生成,3 条 unigene.参与萜类骨架合成,25 条 unigene 可能参与萜类最后的修饰。结论 首次对青叶胆转录组进行测序分析,获得了可能参.与獐牙菜苦苷生物合成的候选基因,为后续功能基因的挖掘奠定了基础。