条斑紫菜DnaJ基因家族鉴定及其在环境胁迫下的表达分析
条斑紫菜DnaJ基因家族鉴定及其在环境胁迫下的表达分析
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DOI：
10.16441/j.cnki.hdxb.20210335
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
殷吉强
中科院分区：
文献类型：
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作者：
孙斌;孔凡娜;殷吉强
针对条斑紫菜(Pyropia yezoensis)DnaJ(PyDnaJ)家族研究相对较少的现状,本研究利用生物信息学方法对PyDnaJ基因家族及其在胁迫条件下的表达模式进行探究,以便为进一步解析条斑紫菜抗逆机制奠定前期工作基础。本研究鉴定出27个DnaJ蛋白(PyDnaJ01~27),并发现:其编码氨基酸数量范围为191~980;大部分DnaJ定位于高尔基体和细胞核;成员的基因结构简单,内含子较少;根据所含结构域不同可分为A、B、C三类;27个成员散布于3条染色体上。其中:PY_1染色体含DnaJ基因最多(11个);PyDnaJ01和PyDnaJ10为片段重复基因;PY_2和PY_3染色体上各有8个DnaJ基因;DnaJ基因启动子区域含有不同数目的胁迫响应元件和植物激素响应元件。系统发生分析表明PyDnaJ蛋白家族可以分成10个亚群。qRT-PCR结果显示,PyDnaJ家族成员在孢子体世代下的表达水平显著高于配子体世代,PyDnaJ家族成员在失水及温度胁迫下具有不同表达模式。