基于单细胞转录组测序探索FABP5在矽肺纤维化中II型肺泡上皮细胞的特异性表达
基于单细胞转录组测序探索FABP5在矽肺纤维化中II型肺泡上皮细胞的特异性表达
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DOI：
10.11836/jeom22126
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
巢杰
中科院分区：
文献类型：
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作者：
杨少奇;史晓妮;成于思;巢杰
[背景]矽肺是由于长期吸入大量游离的二氧化硅(SiO_2)颗粒所致,探讨其机制可以为矽肺纤维化的治疗提供新的方向。[目的]本研究着重探讨脂肪酸结合蛋白5(FABP5)在SiO_2诱导的矽肺模型中的表达及发挥的作用。[方法]结合前期单细胞转录组测序结果,利用生物信息分析技术对小鼠肺泡上皮细胞进行分群并探索FABP5的表达模式;采用空间转录组学技术探索fabp5的分布模式。小鼠气管滴注SiO_2建立矽肺纤维化模型,设置4个组别:生理盐水(normal saline,NS)7 d组、NS 56 d组、SiO_2 7 d组、SiO_2 56 d组。SiO_2处理小鼠肺上皮细胞系(MLE-12)建立矽肺体外模型。在动物整体水平,利用组织免疫荧光实验检测上皮细胞的标志物(E-Cad)和FABP5的蛋白水平;在体外水平,利用MLE-12验证细胞模型中fabp5 mRNA表达变化和蛋白水平变化。[结果]单细胞转录组测序结果及空间转录组测序结果显示在小鼠矽肺病灶区域II型肺泡上皮细胞中fabp5 mRNA表达上调,伴随着组织免疫荧光蛋白水平升高,且与E-Cad存在共定位现象。同时SiO_2刺激诱导MLE-12细胞中fabp5 mRNA表达升高至1.58倍和蛋白水平上升至2倍,差异均具有统计学意义(P <0.05)。[结论]在肺纤维化模型的肺泡上皮细胞中,FABP5的蛋白水平上升,提示FABP5可能参与上皮细胞在肺纤维化病理进程。